JRI可以在Vista上访问用户安装的软件包吗？

Question

我开发了一个使用JRI来使用ptw包的Java应用程序。

在Linux（Ubuntu 10.04，R 2.10.1，JRI 0.5.0）上运行正常。

但是，在Vista（R 2.12.0，JRI 0.5.0）上，当应用程序评估“library（ptw）”时，会发生以下错误：

库中的错误（ptw）：找不到对象'ptw'

当我从Vista命令行运行R并发出“library（ptw）”命令时，没有问题。

如果我将ptw软件包从我的％USERPROFILE％\ Documents \ R \ win-library复制到％R_HOME％\ library，则问题就会消失。但是，我不希望我的用户必须这样做，事实上，有些人可能没有这样做的许可。

因此，如何让JRI调用可以访问用户已在其中安装的软件包的R-Engine ％USERPROFILE％\文件\ r \双赢的图书馆吗？

我在r-help邮件列表上也asked，但没有快乐。

我知道library（）函数的 libloc 参数，但我更喜欢一些不那么脆弱的东西，即自动而不是需要配置......

Answer 1

如果位置不同于默认位置，则应在Rprofile.site文件中提及它们，其中使用.libPaths()或设置.Library.site变量。检查您是否可以在R版本的Rprofile.site文件中找到它，让您的应用程序打印函数.libPaths()的输出。

据我所知（但我可能错了），JRI使用Rserve，它不会以经典的方式启动R.我怀疑在Windows上这会以某种方式忘记Rprofile.site（事实上这将是一个bug）。看不出为什么它不起作用的另一个原因，但我不是专家。

一种解决方案是：

• 在开头使用Rprofile.site。
• 或向.libPaths()添加任何可能的位置（请参阅?.libPaths）
• 或在脚本中自行设置.Library.site变量

您可能想要检查问题是否仍然存在于Windows 7上，因为我注意到某些程序在使用Vista时尝试连接到R的问题行为，而相同的版本在Windows 7上运行正常。

Answer 2

％USERPROFILE％\ Documents \ R \ win-library是一个“非标准”库位置，尽管它在用户是非管理员时自动添加到.libPaths（）。

启动JRIEngine后，您可以手动添加库位置。

jriengine.parseAndEval(".libPaths(<the directory>)");

Answer 3

感谢Joris和Ian的评论，我发现在运行应用程序之前明确设置 R_LIBS_USER 环境变量解决了这个问题。

无论出于何种原因，这只是Vista（与Linux相比）所必需的。在两个系统上，Rprofile.site文件都是空模板。