我有两个文件
file1
:
>string1<TAB>Name1
>string2<TAB>Name2
>string3<TAB>Name3
file2
:
>string1<TAB>sequence1
>string2<TAB>sequence2
我想使用awk
来比较各个文件的第1列。如果两个文件共享第1列值,我想打印file1的第2列,然后是file2的第2列。例如,对于上述文件,我的预期输出是:
Name1<TAB>sequence1
Name2<TAB>sequence2
这是我的代码:
awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"} FNR == NR { a[$1] = $1; next } $1 in a { print a[$2], $2 }' file1 file2 >out
但我唯一得到的是空的第一列序列
这里的错误在哪里?
答案 0 :(得分:2)
你的作业不对。
$ awk 'BEGIN {FS=OFS="\t"}
NR==FNR {a[$1]=$2; next}
$1 in a {print a[$1],$2}' file1 file2
Name1 sequence1
Name2 sequence2