R caret的rfe函数中的“承诺已被评估”错误

Question

我有一个矩阵X和向量Y，我将其用作rfe包中caret函数的参数。它很简单：

我得到一个奇怪的错误，我无法解读：

  

承诺已经在评估中：递归默认参数引用或早期问题？

编辑： 以下是我数据前5行的可重现示例：

library(caret)

X_values = c(29.04,96.57,4.57,94.23,66.81,26.71,69.01,77.06,49.52,97.59,47.57,64.07,24.25,11.27,77.30,90.99,44.05,30.96,96.32,16.04)
X = matrix(X_values, nrow = 5, ncol=4)
Y = c(5608.11,2916.61,5093.05,3949.35,2482.52)

rfe(X, Y)

我的R版本是3.2.3。 Caret包装是6.0-76。

有人知道这是什么吗？

Answer 1

您的代码存在两个问题。

1. 您需要指定要适合的函数/算法。 （这就是导致你得到的错误信息的原因。我不确定为什么rfe抛出这样一个神秘的错误信息;它确实很难调试。）
2. 您需要在输入数据中命名列。

以下作品：

library(caret)

X_values = c(29.04,96.57,4.57,94.23,66.81,26.71,69.01,77.06,49.52,97.59,47.57,64.07,24.25,11.27,77.30,90.99,44.05,30.96,96.32,16.04)
X = matrix(X_values, nrow = 5, ncol=4)
Y = c(5608.11,2916.61,5093.05,3949.35,2482.52)

ctrl <- rfeControl(functions = lmFuncs)
colnames(X) <- letters[1:ncol(X)]

set.seed(123)
rfe(X, Y, rfeControl = ctrl)

我为rfe选择了一个线性模型。 警告消息的原因是交叉验证期间数据中的观察次数较少。您可能还想设置sizes参数以获得有意义的特征消除。