我有一个简单的任务,我尝试了几种解决方案,但似乎无法弄明白。
我有一组包含基因名称和相应位置的集合,如:
gene_nr_snp = {'gene1: {3,9}, gene2: {2,3,1}, gene3: {1}}
我想返回一个带有基因名称和相应求和值的字典。
我尝试了以下内容:
gene_values = {}
for gene, snp in gene_nr_snp.items():
for i in snp: # iterate the values in each set
snp_total = 0
snp_total += i
gene_values[gene].add(snp_total)
这将返回相同的值集
答案 0 :(得分:7)
您可以使用词典理解和sum()
function:
gene_values = {gene: sum(snp) for gene, snp in gene_nr_snp.items()}
您的尝试失败是因为您为snp_total
中的每个值设置0
变量为snp
,因此无法对任何内容求和。然后,您似乎将gene_values[gene]
视为一个集合,但字典开始为空,因此您将获得KeyError
。工作版本将是:
gene_values = {}
for gene, snp in gene_nr_snp.items():
snp_total = 0
for i in snp: # iterate the values in each set
snp_total += i
gene_values[gene] = snp_total
但sum()
函数使内循环比需要的更冗长;整个循环体可以用gene_values[gene] = sum(snp)
替换。