我为最大似然编写了一个简单的函数,并希望这个函数在R中使用for
循环基于其参数的不同值给出不同的结果。这是我的函数包括基于{{1的表达式循环。我的功能运行良好,结果保存在列表中。然后,由于我有两个不同的结果,我想根据函数的每个部分将for
函数应用于我的函数。例如,
optim
然后我的功能结果是:
ff <- function(x,mu=c(2,0.5),sd=c(0.2,0.3)){
out <- vector("list",2)
for (i in 1:2){
out[[i]] <- -sum(log(dnorm(x,mu[[i]],sd[[i]]))) ## here I have two different part of my funcitons wrap as one using for loop.
}
return(out)
}
set.seed(123)
x <- rnorm(10,2,0.5)
x
然后,由于我的函数有两个不同的部分使用> ff(x)
[[1]]
[1] 25.33975
[[2]]
[1] 101.4637
循环换行,我想基于它的每个部分将optim函数应用于此函数。我尝试了很多自己的方法而且没有用。这是我的尝试之一:
for
也就是说,我希望op <- vector("list",2)
for(i in 1:2){
op <- optim(c(0.5,0.5),fn=ff[[i]],i=i)
}
函数在我的参数optim
的第一个值处评估我的函数,然后评估第二个i=1
的函数。
所以没有换行的我的功能如下:
i=2
然后我需要为每个函数使用两个不同的ff_1 <- function(x,mu=c(2,0.5),sd=c(0.2,0.3)){
-sum(log(dnorm(x,mu[[1]],sd[[1]])))
return(out)
}
ff_2 <- function(x,mu=c(2,0.5),sd=c(0.2,0.3)){
-sum(log(dnorm(x,mu[[2]],sd[[2]])))
return(out)
}
函数。
我搜索了许多网站和R帮助网站,但我找不到这个问题的解决方案。
请帮忙吗?
答案 0 :(得分:1)
尝试这个,它只是将参数传递给optim的方式,我想
# given data
set.seed(123)
x <- rnorm(10,2,0.5)
# use vector parOpt instead of specifying two; for convience
# with optim
ff <- function(x, parOpt){
out <- -sum(log(dnorm(x, parOpt[1], parOpt[2])))
return(out)
}
# parameters in mu,sd vectors arranged in list
params <- list(set1 = c(2, 0.2), set2 = c(0.5, 0.3))
# output list
out <- list()
for(i in 1:2){
# pass params (mu and sd) to optim, function ff and the data
# note, since function ff has x argument, specify that in optim
out[[i]] <- optim(par = params[[i]], fn=ff ,x=x)
}
应该给出这样的东西:
[[1]]
[[1]]$par
[1] 2.0372546 0.4523918
[[1]]$value
[1] 6.257931
[[1]]$counts
function gradient
55 NA
[[1]]$convergence
[1] 0
[[1]]$message
NULL
[[2]]
[[2]]$par
[1] 2.037165 0.452433
[[2]]$value
[1] 6.257932
[[2]]$counts
function gradient
73 NA
[[2]]$convergence
[1] 0
[[2]]$message
NULL
希望这有帮助。
答案 1 :(得分:1)
作为替代方案,您可以使用fitdist
包的fitdistrplus
命令找到相同的解决方案:
library(fitdistrplus)
set.seed(123)
x <- rnorm(10,2,0.5)
mu.start <- c(2,0.5)
sd.start <- c(0.2,0.3)
op <- vector("list",2)
for(i in 1:2){
op[[i]] <- fitdist(x,"norm", start=c(mu.start[i],sd.start[i]))
}
op
结果是:
[[1]]
Fitting of the distribution ' norm ' by maximum likelihood
Parameters:
estimate Std. Error
1 2.0372546 0.1430588
2 0.4523918 0.1011464
[[2]]
Fitting of the distribution ' norm ' by maximum likelihood
Parameters:
estimate Std. Error
1 2.037165 0.1430719
2 0.452433 0.1011694