如何在bash shell脚本中计算文件中每行的中位数

Question

我正在尝试从bash shell脚本中的文件计算每行的中位数。我相信有一种方法可以通过使用切换，排序，头部和尾部的流水线命令来实现这一点，但我无法弄清楚如何将此过程集成到我现有的代码中。我想在计算平均值的同一点计算中位数。这样做的最佳方式是什么？

while read i
do
    sum=0
    count=0
    mean=0
    median=0
    for num in $i
    do
        sum=$(($sum + $num))
        count=`expr $count + 1`
        mean=`expr $sum / $count`
        #Need to calculate the median
    done
    echo "Sum: $sum Mean: $mean"
done < $2

Answer 1

awk救援！

awk '{sum=0; 
      n=split($0,a); 
      for(i=1;i<=n;i++) sum+=a[i]; 
      asort(a); 
      median=n%2?a[n/2+1]:(a[n/2]+a[n/2+1])/2; 
      print sum, sum/n, median}' file

bash不适合执行此任务。

Answer 2

假设行长度可变：

1. 使用bash和datamash：

   while read x
   do    tr -s '\t' '\n' <<< "$x" | \
         datamash  median 1
   done < file
   

2. 使用numaverage：

   while read x
   do    tr -s '\t' '\n' <<< "$x" | \
         numaverage -M
   done < file