Question

我正在尝试在R中使用cooccur包，并且想知道是否有人使用过这个包或者为什么我收到错误：

Error in FUN(left, right) : non-numeric argument to binary operator

以下是我正在使用的.csv文件的片段，如果有任何用处的话。第一栏目前没有标题，因为我一直尝试不同的方法使其发挥作用。

,bL,bD,eC,eH,eL,eT
NLA12AL101,1,1,0,0,0,1
NLA12AL102,0,1,0,0,0,0
NLA12AL104,1,1,0,0,0,0
NLA12AL105,0,0,0,0,0,1
NLA12AL112,1,0,0,0,0,0
NLA12AL113,1,1,0,0,0,0
NLA12ALR03,1,0,0,0,0,1
NLA12ALR05,0,0,0,0,0,1

我不确定我是否正在加载错误的文件，但这里是代码：

mydata <- read.csv("C:\\Users\\Tom\\Documents\\bosmina.csv", 
stringsAsFactors = FALSE)

以下是我用于cooccur的代码：

cooccur.mydata <- cooccur(mat = mydata, type = "site_spp", thresh = TRUE, 
spp_names = TRUE)

我是R的新手，我在Stack Overflow上发现了类似的问题，但我仍然无法弄清楚这个错误究竟意味着什么。如果这是一个非常简单的问题我很抱歉，但我正试图自己想出这个程序。提前谢谢。

Answer 1

我是cooccur的作者。感谢您对该套餐感兴趣。读入数据后，需要将行名称移动到row.names中，以便不将它们视为数据。如果你的行名称在一个名为rnames的列中，那么一种方法是row.names（mydata）＆lt; - mydata $ rnames; mydata $ rnames＆lt; - NULL。看起来这是唯一的问题，但如果出现其他问题，请告诉我。您可以使用维护者（“cooccur”）来获取我的电子邮件。丹格里菲斯

使用cooccur包时FUN（左，右）出错

1 个答案: