Question

我有一个基本文件夹，里面有很多文件夹。我想转到每个文件夹，找到一个名为table_amzn.csv（如果存在）的文件，然后读取R中的所有这些文件，并将所有文件一个接一个地放在一个数据帧中。我已经验证所有文件都有相同的列。我知道如何将CSV读入R.但是我怎么能遍历基础文件夹中的所有文件夹并连接数据

Answer 1

以下是最近添加到包rio的实现：

files <- list.files(pattern = "table_amzn.csv", recursive = TRUE, full.names = TRUE)

devtools::install_github("leeper/rio")
library(rio)
df <- import_list(files, rbind = TRUE)

这会将files中的所有对象加载到单个data.frame对象中。或者，如果您使用rbind = FALSE进行呼叫，则会返回data.frames列表

Answer 2

这在基础R中也可以直接：

## change `dir` to whatever your 'base folder' actually is
dir <- '~/base_folder'
ff <- list.files(dir, pattern = "table_amzn.csv", recursive = TRUE, full.names = TRUE)

out <- do.call(rbind, lapply(ff, read.csv))

如果您的列相同但由于某种原因（拼写错误等）具有不同的列名称，您可以修改上述内容，如：

out <- do.call(rbind, lapply(ff, read.csv, header = FALSE, skip = 1))
names(out) <- c('stub1', 'stub2') # whatever they should be

r循环遍历文件夹并搜索文件，然后连接数据

2 个答案: