Question

我正在尝试根据两列的值对pandas数据帧进行排序。由于某种原因，它将整数视为字符串，而早期的几个代码仍然是整数。不确定是什么导致了这些变化，但无论如何：

df = 

contig  pos ref haplotype_block hap_X   hap_Y   odds_ratio  My_hap  Sp_hap
2   5207    T   1856    T   A   167.922 T   A
2   5238    G   1856    C   G   -   C   G
2   5723    A   1856    A   T   -   A   T
2   5867    C   1856    T   C   -   T   C
2   155667  G   2816    G   *   1.0 N   N
2   155670  T   2816    T   *   -   N   N
2   67910   C   2   C   T   0.21600000000000003 T   C
2   67941   A   2   A   T   -   T   A
2   68016   A   2   A   G   -   G   A
2   118146  C   132 T   C   1369.0  T   C
2   118237  A   132 C   A   -   C   A
2   118938  A   1157    T   A   0.002   A   T


df.sort_values(by=['contig', 'pos'], inplace=True, ascending=False)

print(df) #is giving me


contig  pos ref haplotype_block hap_X   hap_Y   odds_ratio  My_hap  Sp_hap
2   118146  C   132 T   C   1369.0  T   C
2   118237  A   132 C   A   -   C   A
2   118938  A   1157    T   A   0.002   A   T
2   155667  G   2816    G   *   1.0 N   N
2   155670  T   2816    T   *   -   N   N
2   5207    T   1856    T   A   167.922 T   A
2   5238    G   1856    C   G   -   C   G
2   5723    A   1856    A   T   -   A   T
2   5867    C   1856    T   C   -   T   C
......

因此，它只使用两列(contig and pos)的第一个数字对数据进行排序。为什么会这样？和一个非常简单的记忆有效的解决方法？

谢谢，

发布修改详情

print(df.info())

<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
RangeIndex: 333 entries, 0 to 332
Data columns (total 9 columns):
contig             333 non-null int64
pos                333 non-null object
ref                333 non-null object
haplotype_block    333 non-null int64
hap_X              333 non-null object
hap_Y              333 non-null object
odds_ratio         333 non-null object
My_hap             333 non-null object
Sp_hap             333 non-null object
dtypes: int64(2), object(7)
memory usage: 23.5+ KB
None

Answer 1

将值转换为整数：

df['contig'] = df['contig'].astype(int)
df['pos'] = df['pos'].astype(int)

然后按inplace

排序

df.sort_values(by=['contig', 'pos'], inplace=True, ascending=True)

谢谢，

Pandas在排序时将整数值视为字符串？为什么？

1 个答案: