误差条重叠,但在glmm中效果很明显。发生了什么事?

时间:2017-04-12 20:24:44

标签: r lme4

我运行了以下glmm:

mod<-glmer(data=newdata, total_flr_vis ~ treatment + flr_num + (1|individual), family=poisson)

并从summary()

获取此输出
Generalized linear mixed model fit by maximum likelihood (Laplace Approximation) ['glmerMod']
Family: poisson  ( log )
Formula: total_flr_vis ~ treatment + flr_num + (1 | individual)
Data: newdata

 AIC      BIC   logLik deviance df.resid 
706.8    718.9   -349.4    698.8      148 

Scaled residuals: 
Min      1Q  Median      3Q     Max 
-3.1461 -0.8155 -0.3522 -0.2022 14.1669 

Random effects:
Groups     Name        Variance Std.Dev.
individual (Intercept) 4.066    2.016   
Number of obs: 152, groups:  individual, 42

Fixed effects:
            Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)    
(Intercept) -1.610176   0.432666  -3.722 0.000198 ***
treatmentR  -0.457492   0.121054  -3.779 0.000157 ***
flr_num      0.037063   0.005064   7.319  2.5e-13 ***
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1

Correlation of Fixed Effects:
             (Intr) trtmnR
  treatmentR -0.117       
  flr_num    -0.416  0.040

但是我使用treatment

获得plot(allEffects(mod))的以下图表

enter image description here

我不明白为什么效果图显示重叠的误差条,而summary()输出告诉我treatment的效果很重要。模型有问题,还是情节?我该如何解决这个问题?

这是残差图(我使用plot(mod)

enter image description here

我不完全确定如何解释这个情节,但它对我来说并不随意,因此我怀疑这个模型有问题。

如果有人可以告诉我该怎么做,我很乐意发布数据。

非常欢迎任何帮助。

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