在我的脚本中,我需要比较相当大的NumPy数组(2D或3D)和阈值。 比较本身可以通过" allclose"轻松完成。功能,就像那样:
Threshold = 0.1
if (np.allclose(Arr1, Arr2, Threshold, equal_nan=True)):
Print('Same')
知道哪些单元格不相同的最简单(但又天真)的方法是使用像这样的简单for循环代码:
def CheckWhichCellsAreNotEqualInArrays(Arr1,Arr2,Threshold):
if not Arr1.shape == Arr2.shape:
return ['Arrays size not the same']
Dimensions = Arr1.shape
Diff = []
for i in range(Dimensions [0]):
for j in range(Dimensions [1]):
if not np.allclose(Arr1[i][j], Arr2[i][j], Threshold, equal_nan=True):
Diff.append(',' + str(i) + ',' + str(j) + ',' + str(Arr1[i,j]) + ','
+ str(Arr2[i,j]) + ',' + str(Threshold) + ',Fail\n')
return Diff
(对于3D阵列也是如此 - 还有1个用于循环)
当阵列很大并且充满了不相等的单元时,这种方式非常慢。
是否有快速直接的方式以防它们不相同 - 获得不均匀细胞的列表?也许是NumPy本身的一些内置函数?
答案 0 :(得分:0)
函数allclose
相当于all
和isclose
的组合。因此,您可以将isclose
应用于整个数组,然后根据需要将all
应用于某些轴,而不是循环遍历数组的某些维。 (至关重要的是,all
采用轴参数而allclose
没有)。具有4D随机数据阵列的示例,其中正在比较一些2D切片。
threshold = 0.1
arr1 = 10 + np.random.normal(size=((40, 30, 20, 10)))
arr2 = arr1 + 0.3 * np.random.normal(size=((40, 30, 20, 10)))
print(np.all(np.isclose(arr1, arr2, threshold), axis=(2, 3)))
打印一个2D数组,显示哪个切片满足allclose
条件:
array([[False, True, True, ..., True, True, False],
[ True, False, True, ..., True, True, False],
[False, True, True, ..., False, True, True],
...,
[False, False, True, ..., True, True, True],
[ True, True, True, ..., False, True, True],
[ True, False, True, ..., True, False, False]], dtype=bool)
也就是说,arr1[0, 0]
和arr2[0, 0]
并不接近;但是arr1[0, 1]
和arr2[0, 1]
是。如有必要,您可以深入查看元素级别,以找出close
条件的确切失败; np.isclose(arr1, arr2, threshold)
拥有所有这些信息。