Question

我正在尝试使用粘贴与gnuplot中的awk组合，以便我可以获取两个不同文件的某些列并绘制结果。但是，我收到了这个错误：

sh: 1: Syntax error: "(" unexpected

我知道它对我的gnuplot脚本的那部分不满意：

system("paste <(awk '{print $1,$2,$3,$4,$5,$14}' ".filename(i).") <(awk '{print $14}' ".filename_without.")  > Tim_res_".i)

更具体地说是awk之前的括号。在不使用变量名的情况下替换文件名也不起作用，而所有命令在gnuplot之外完全正常工作。如果我删除括号，那么它表示它不识别awk，并且命令在gnuplot之外也不起作用。

我已经读过添加#!/usr/bin/bash可能有所帮助，但它实际上并没有解决问题，也没有给出另一个错误消息。我之前从未在gnuplot中使用过这样的命令。我有很多文件以类似的方式绘制，因此为什么我想直接在gnuplot中使用它，system命令只是为了确保它在我可以直接替换它之后才能使用{gnuplot的plot命令。

感谢您的帮助

Answer 1

您的命令（如错误消息所示）是使用sh（/bin/sh）执行的，这是gnuplot的system命令使用的。

sh ，只能假定具有POSIX强制功能，不支持process substitutions (<(...)) ，这是非标准的Bash特征

Tom Fenech's helpful answer显示了你的命令的重新制定，完全绕过了过程替换的需要。

如果您确实需要（相当于）流程替换：

（a）要么：调用bash -c作为system()命令字符串的一部分，将原始命令（显示引用挑战）传递给它。
（b）或：使用临时文件而不是进程替换;在您的情况下，创建至少一个包含awk输出的临时文件，然后将其传递给paste。

简化示例：

（a）使用嵌入式bash -c电话：

system("bash -c \"paste <(cat '".filename1."') <(cat '".filename2."')\"")

注意内部命令如何包含在\"中，因此可以作为单个参数传递给bash -c。

（b）使用临时文件：

system("cat '".filename1."'>>/tmp/$$; cat '".filename2."' | paste /tmp/$$ -; rm /tmp/$$")

注意1 awk命令如何通过管道向paste提供输入，但另一个命令需要临时文件。

Answer 2

mklement0 has explained问题是什么 - 解决方法是完全避免进程替换：

awk 'NR == FNR { col[NR] = $14; next } { print $1,$2,$3,$4,$5,$14,col[FNR] }' file2 file1

即，首先读取第二个文件并保存列，然后执行＆＃34;粘贴＆＃34;你自己在awk。

将awk命令移动到gnuplot：

system("awk 'NR == FNR { col[NR] = $14; next } \
{ print $1,$2,$3,$4,$5,$14,col[FNR] }' " . filename_without . " " . filename(i))

gnuplot5 - sh：1：语法错误：“（”awk意外

2 个答案:

简化示例：