Question

我是这个论坛的新手，也是R的新手。但最近我被介绍到Rstudio中的rmarkdowns并且我已经准备好了一个脚本，它使用一些csv文件来运行一些计算，然后创建一些图表。

脚本如下（附带数据）：SE_MACover_Abr2014_40m_CP.csv

```{r prepare the data} 

df <- read.csv(file.choose()) #SE_MACover_Abr2014_40m_CP.csv 

#   call the libraries 

library(ggplot2) 
library(plyr) 
library(reshape2) 

str(df) 
df 

## create factor levels 
df$Stat <-factor(df$Stat, levels = c("SE_Mean", "SE_Min","SE_Max")) 

df$Imgs <- factor(df$Imgs, levels = c("2", "5","10", "20","30", "40", "50",     "60", "70")) 
df$Stat 
df$Imgs 

```{r plot means, mins, and maxs} 
Plot1 <- ggplot(data = df, aes(x = Imgs, y = X, group = Stat)) + 
geom_line(aes(linetype = Stat, colour = Stat), size = 1) + 
geom_point(aes(colour=Stat)) + 
ylab(bquote('Standard Error ')) + 
xlab(bquote('Number of Images')) 
Plot1

我在R base中尝试了这个并且工作正常，但是Rstudio中的rmarkdown图表没有绘制，它给了我以下错误消息：

错误（函数（filename =“Rplot％03d.png”，width = 480，height = 480，：invalid'filename'

查看追溯它显示以下内容：

停止（“无效'文件名'”）
（function（filename =“Rplot％03d.png”，width = 480，height = 480，units =“px”，pointsize = 12，bg =“white”，res = NA，family =“sans”， restoreConsole = TRUE，type = c（“windows”，“cairo”，“cairo-png”），antialias = c（“default”，“none”，“cleartype”，“grey”，“subpixel”））.. 。
do.call（what = png，args = args）
.rs.createNotebookGraphicsDevice（filename，height，width，units，pixelRatio，extraArgs）
（function（）{。rs.createNotebookGraphicsDevice（filename，height，width，units，pixelRatio，extraArgs）...
grid.newpage（）
print.ggplot（x）
function（x，...）UseMethod（“print”）（x）

我甚至尝试用这段代码绘制最简单的图形：

 x <- c(1,2,3,4,5,6) 
 y <- c(1,2,3,4,5,6) 
 plot(x,y)

当我试图解决这个问题时，我认为我的脚本存在问题，有人建议将用于绘图的脚本直接粘贴到控制台中。我这样做了，它有效！它在rmarkdown中产生相同的错误，但它在控制台中运行良好..

我不知道如何解决这个问题，所以我可以运行我的降价文件，它会创建我需要的图表，

请帮帮我

Answer 1

当生成rmarkdown文档时临时路径加上RStudio创建的文件名太长时，通常会出现此问题。在Windows系统上，该长度通常为260个字符，但是确切的长度取决于您的磁盘是否使用FAT，NTFS等进行格式化。请注意，问题是由RStudio创建的临时文件-您通常无法控制这些文件。 / p>

但是，您可以控制rmarkdown文档的路径长度。如果足够短，它将为RStudio留下“空格”以创建临时文件名。

或者，重新启动RStudio通常也可以，尽管在处理rmarkdown文档时，如果再次遇到问题，则必须再次重新启动。

Answer 2

我有同样的问题，我刚刚意识到这是由于我的Rmd文件的文件名 - 我在名称中使用了％。删除符号后问题消失了。您的Rmd文件的文件名是什么？也许你应该尝试重命名你的文件。

绘图时rmarkdown中的错误

2 个答案: