氨基酸频率直方图与字母

Question

我试图获得肽库中氨基酸组成和频率的图形视图。

我知道如何使用R创建基本直方图，但我经常看到这种plot in publication

我能用R做到类似的东西吗？

Answer 1

这种类型的数字通常使用WebLogo或类似的软件生成。

有一个R wrapper for WebLogo。它已经有几年了，我不知道它有多好用。

还有ggseqlogo（最近，看起来相当不错），在Bioconductor包中，seqLogo;我不知道后者是否处理多肽。