R减去行名称使名称有时无法访问

Question

我有一个错误，我无法用较小的示例重新创建，所以我希望任何人都知道在哪里查看。

问题

如代码注释中所述：rownamesX在矩阵的rownames中找不到（但它们当然在那里）。如果我打印未找到的名字，会出现类似的内容：

• hsaâ'miRâ'00

应该是

• HSA-的miR-00

此外，我测试了一些不同的方法：

• 如果我直接在控制台的Rstudio中输出下标（ctrl-shift -s热键），则代码有效
• 如果我在控制台中调用该功能（行上的Ctrl-Enter）
，则代码有效
• 如果下标是在主脚本中通过（行中的Ctrl-Enter）来源代码，则代码不起作用
• 如果整个main.R来源代码不起作用（ctrl-shift-s热键）

我的环境：

1. 数据矩阵
   • ~200k元素
   • “type-type2-number”形式的rownames
   • colnames（= samples）：“S1”，“S2”，...
2. 电话：
   • 主要脚本
     • 提供下标
       • 提供功能
       • 使用数据矩阵作为参数
       调用该函数

3. 功能：

   myFunction <- function(rownamesX = c("type-type2-number")
                          ,mat){
       indexes <- which(rownames(mat) %in% rownamesX) # This is empty
       mat.part <- mat[indexes, ] # therefore his is empty
       resp <- mat.part[1, ] - mat.part[2, ] # therefore this yields an error 
   }
   

Answer 1

错误很简单： 有多个＆＃34; - ＆＃34;：

-

-

这两个在Rstudio中看起来比在这里更平等。所以当第二个（较小的）在rowname中时，我寻找第一个（较大的）