R中两个序数变量的相关性

Question

我想测试两个序数变量的spearman相关性。

x=c(1,2,3)
y=c(4,3,6)
x=ordered(x)
y=ordered(y)
cor(x,y,methods="spearman")

我总是得到“cor（x，y）中的错误：'x'必须是数字”

这样做的正确方法是什么？

Answer 1

两种方法：

1. 使用as.numeric。

   x=c(1,2,3)
   y=c(4,3,6)
   x=ordered(x)
   y=ordered(y)
   cor(as.numeric(x), as.numeric(y), method="spearman")
   [1] 0.5
   

请注意，这是不将x和y简单地视为连续数字。它将它们视为等级。

as.numeric(y)
[1] 2 1 3

此方法允许您忽略NA值。

x=c(1,2,3, NA)
y=c(4,3,6, 7)
x=ordered(x)
y=ordered(y)
cor(as.numeric(x), as.numeric(y), 
    method="spearman", use="pairwise.complete.obs")
[1] 0.5

1. 您可以使用将处理有序因子的包pspearman。

   x=c(1,2,3)
   y=c(4,3,6)
   x=ordered(x)
   y=ordered(y)
   
   library(pspearman)
   spearman.test(x,y)
   
   
   Spearman's rank correlation rho
   
   data:  x and y
   S = 2, p-value = 1
   alternative hypothesis: true rho is not equal to 0
   sample estimates:
   rho 
   0.5 
   

或者，如果您想减少部分输出，可以使用：

spearman.test(x,y)$estimate
rho 
0.5 

Answer 2

你遇到了一些问题：

1. 使用ordered会创建一个因子，您可以使用rank
2. 您输错了，method=...不是methods=...

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x=c(1,2,3)
y=c(4,3,6)
x=rank(x)
y=rank(y)
cor(x,y,method="spearman")