Question

我正在努力为我的项目更好地使用org-mode。我认为文字编程尤其适用于数据分析领域，而组织模式让我们可以做一些非常棒的文字编程。

我想大多数人都会同意我的看法，编写分析的工作流程与大多数其他类型的编程不同。我不只是写一个程序，我探索数据。而且，虽然其中许多探索都是死路一条，但我不想完全删除/忽略它们。我每次执行org文件时都不想重新运行它们。我也倾向于找到或开发一些有用的代码，我想把它放到一个分析模板中，但是这些块中的一些对于每个项目都不相关，我想知道如何让org-mode忽略这些我执行整个缓冲区时的块。这是一个简化的例子。

* Import
  - I want org-mode to ignore import-sql.
#+srcname: import-data
#+begin_src R :exports none :noweb yes
<<import-csv>>
#+end_src

#+srcname: import-csv
#+begin_src R :exports none
data <- read.csv("foo-clean.csv")
#+end_src

#+srcname: import-sql
#+begin_src R :exports none
library(RSQLite)
blah blah blah
#+end_src

* Clean
  - This is run on foo.csv, producing foo-clean.csv
  - Fixes the mess of -9 and -13 to NA for my sanity.
  - This only needs to be run once, and after that, reference.
  - How can I tell org-mode to skip this?
#+srcname: clean-csv
#+begin_src sh :exports none
sed .....
#+end_src

* Explore

** Explore by a factor (1)
   - Dead end. Did not pan out. Ignore.
   - Produces a couple of charts showing there is not interaction.
#+srcname: explore-by-a-factor-1
#+begin_src R :exports none :noweb yes
#+end_src

** Explore by a factor (2)
   - A useful exploration that I will reference later in a report.
   - Produces a couple of charts showing the interaction of my variables.
#+srcname: explore-by-a-factor-2
#+begin_src R :exports none :noweb yes
#+end_src

我希望能够使用org-babel-execute-buffer并让org-mode以某种方式知道跳过代码块import-sql，clean-csv和explore-by-a-factor-1。我想在org文件中使用它们，因为它们与项目相关。毕竟，明天有人可能想知道为什么我这么肯定探索因素1没有用。我想保留那些代码，所以我可以敲出情节或分析或者什么，然后继续，但是没有它每次都重新运行，因为没有理由运行它。同样干净的csv东西。我想要它，记录我对数据做了什么（以及为什么），但我不想每次都重新运行它。我将导入foo-clean.csv。

我在谷歌上搜索并阅读了一堆组织模式邮件列表档案，我能够找到一些想法，但不是我想要的。导出文件时，EXPORT_SELECT_TAGS，EXPORT_EXCLUDE_TAGS非常棒。并且：tangle标头在创建实际源文件时效果很好。我不想做其中任何一个。我只想执行缓冲区。我希望能够以类似的方式定义代码块以便执行或忽略。我想我想找到一种方法来获得一个org变量，例如：

EXECUTE_SELECT_TAGS

这样我就可以简单地标记我的各种代码块并完成它。如果我可以运行该文件，只使用具有特定标签的源块，那就更好了。我找不到办法做到这一点，我想在org-mode中询问/乞求新功能之前我会问。

Answer 1

我发现了。从组织手册：

：eval头参数可用于限制特定代码块的评估。：eval接受两个参数“never”和“query”。：eval永远不会确保永远不会评估代码块，这对于防止危险代码块的评估非常有用。：无论org-confirm-babel-evaluate变量的值如何，eval查询都需要查询代码块的每次执行。

所以你只需要添加

：eval never

到你不想执行的块的标题，并且voilá！

Answer 2

虽然我从来没有得到我的问题的答案，但讨论很有趣，显然基于组织模式的模板对于一些人来说是一个有趣的想法。我将源代码下载到org-mode并查看了org-babel-execute-buffer。正如我所担心的那样，它是一个天真的功能，它完全按照它所说的那样做，仅此而已。（目前）不能传递任何其他参数来影响它的行为。（除非我严重误读了lisp，这完全有可能。）

最终，我认为有用的R模板系统不需要org-babel-execute-buffer。 Babel的noweb功能非常灵活，我认为可以使用noweb构建一个可行的解决方案，而不是尝试开发一个复杂的标记模式来定义如何/何时运行。

对于纠结/导出，仍然可以使用标签来创建可用/合理的输出。

对于任何感兴趣的人：LiterateR

使用这个帖子把它放在那里可能有点粗鲁，但这就是我首先提出问题的原因。 TemplateR是我尝试使R更容易使用。现在，只是一个具有两个简单功能的模板。我认为这是一个概念证明。最终，我想开发一些能够帮助人们更快地开发R项目的东西。 TemplateR将通过以下方式实现： 1.提供强大的结构来发展。 2.提供内置功能，为常见任务提供支持，特别是在可重复研究领域。 3.提供经过测试的代码片段，可以快速重新用于当前项目。

现在，它提供的只是一个基本结构/框架和两个简单的功能。 1.确定缺少哪些R包（基于手动输入到表中的内容）和 2.创建项目目录（图表，数据，报告）。

未来的版本会有更多内容。 README.org和TODO.org进一步详细说明。

使用org-mode构建分析

2 个答案: