当输入文件数量很大时,Map Reduce会超出GC开销限制

时间:2017-03-24 10:56:04

标签: java mapreduce hadoop2

我写了MR作业,它将处理超过5800个输入文件。 当我开始它的时候,#34;线程中的异常"主要" java.lang.OutOfMemoryError:超出GC开销限制"。 下面是异常堆栈跟踪:

Exception in thread "main" java.lang.OutOfMemoryError: GC overhead limit exceeded
    at org.apache.hadoop.security.token.Token.<init>(Token.java:85)
    at org.apache.hadoop.hdfs.protocol.LocatedBlock.<init>(LocatedBlock.java:52)
    at org.apache.hadoop.hdfs.protocolPB.PBHelper.convert(PBHelper.java:755)
    at org.apache.hadoop.hdfs.protocolPB.PBHelper.convertLocatedBlock(PBHelper.java:1174)
    at org.apache.hadoop.hdfs.protocolPB.PBHelper.convert(PBHelper.java:1192)
    at org.apache.hadoop.hdfs.protocolPB.PBHelper.convert(PBHelper.java:1328)
    at org.apache.hadoop.hdfs.protocolPB.PBHelper.convert(PBHelper.java:1436)
    at org.apache.hadoop.hdfs.protocolPB.PBHelper.convert(PBHelper.java:1445)
    at org.apache.hadoop.hdfs.protocolPB.ClientNamenodeProtocolTranslatorPB.getListing(ClientNamenodeProtocolTranslatorPB.java:549)
    at sun.reflect.GeneratedMethodAccessor4.invoke(Unknown Source)
    at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(DelegatingMethodAccessorImpl.java:43)
    at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:606)
    at org.apache.hadoop.io.retry.RetryInvocationHandler.invokeMethod(RetryInvocationHandler.java:187)
    at org.apache.hadoop.io.retry.RetryInvocationHandler.invoke(RetryInvocationHandler.java:102)
    at com.sun.proxy.$Proxy23.getListing(Unknown Source)
    at org.apache.hadoop.hdfs.DFSClient.listPaths(DFSClient.java:1893)
    at org.apache.hadoop.hdfs.DistributedFileSystem$15.<init>(DistributedFileSystem.java:742)
    at org.apache.hadoop.hdfs.DistributedFileSystem.listLocatedStatus(DistributedFileSystem.java:731)
    at org.apache.hadoop.fs.FileSystem.listLocatedStatus(FileSystem.java:1664)
    at org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.FileInputFormat.singleThreadedListStatus(FileInputFormat.java:300)
    at org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.FileInputFormat.listStatus(FileInputFormat.java:264)
    at org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.SequenceFileInputFormat.listStatus(SequenceFileInputFormat.java:59)
    at org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.FileInputFormat.getSplits(FileInputFormat.java:385)
    at org.apache.hadoop.mapreduce.JobSubmitter.writeNewSplits(JobSubmitter.java:589)
    at org.apache.hadoop.mapreduce.JobSubmitter.writeSplits(JobSubmitter.java:606)
    at org.apache.hadoop.mapreduce.JobSubmitter.submitJobInternal(JobSubmitter.java:490)
    at org.apache.hadoop.mapreduce.Job$10.run(Job.java:1295)
    at org.apache.hadoop.mapreduce.Job$10.run(Job.java:1292)
    at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)
    at javax.security.auth.Subject.doAs(Subject.java:415)
    at org.apache.hadoop.security.UserGroupInformation.doAs(UserGroupInformation.java:1642)
    at org.apache.hadoop.mapreduce.Job.submit(Job.java:1292)

Map-Reduce的输入文件数量是否有限制。 我试图用1.2 GB内存alos运行它

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

由于您没有向我们展示任何代码,因此只能进行一般性讨论。

此问题不是由文件 number 的任何Hadoop特定限制引起的。它可能是由于文件的聚合大小...在读取内容并将其加载到堆中之后。但不一定。

这里实际发生的是你已经(几乎)填满了堆,而JVM已经决定你花费太多时间进行垃圾收集。

从广义上讲,造成此类问题的原因有三种:

  1. 堆太小,无法解决您要解决的问题。
  2. 您的应用程序正在低效使用内存。
  3. 您的应用程序存在内存泄漏。
  4. 在你的情况下,我首先假设它是问题1.我会尝试使用更少的文件和/或尝试使用(更多)更大的堆。如果其中任何一个解决了问题,那么(现在)已经完成了,但显然这将限制你可以处理的问题的大小。

    如果这不能解决问题,那么你就会把它看作是在寻找内存泄漏;即找出应用程序使用这么多(太多)内存的原因。

    我会注意到1.2Gb并不是一个特别大的堆。