Question

所以我的目标是提取目录中每个文件的第五行。我的目录中有一堆扩展名（* .gjf），并且在第五行总是“1 0”或“1 1”没有引号。

到目前为止，我知道我可以提取这些值，但不能提取附加到它们的文件名。这是我一直在使用的代码。

    awk 'FNR == 5' *.gjf
1  1
0  1
0  1
1  1
1  1
0  1

我希望我的解析文件看起来像这样。

FILNAME: 1AH7A_TRP-16-A_GLU-9-A.gjf, 1, 1,
FILNAME: 1AH7A_TRP-198-A_ASP-197-A.gjf, 1 , 1,
FILNAME: 1BGFA_TRP-43-A_GLU-44-A.gjf, 0,  1,
FILNAME: CXQA_TRP-61-A_ASP-82-A.gjf, 1, 1,

我希望文件名位于这些值之前，因为我想在R中以逗号分隔的值文件运行这些文件的统计信息（我很有能力这样做），对我来说，我能证明这一点非常重要在我的文件中只有两种模式，模式被命令为“0 1”和“1 0”。

我甚至尝试列出文件

我试过这样做：

grep -l "" *.gjf | awk 'FNR == 5' *.gjf

因为我知道我可以grep文件的存在，并将列表打印到屏幕上。但我想我只是将它传递给了awk，所以计算出来了。

1 1
1 1
0 1
1 1 
etc ...

我认为它只是将文件传递给awk，所以它打印了第n行。我试过用＆amp;＆amp;而不是|，它只是打印完整的文件列表，然后以无组织的方式打印完整的数字列表。显然我不知道该怎么做。

Answer 1

使用GNU awk

gawk -v OFS=", " 'FNR == 5 {print "FILENAME: " FILENAME, $1, $2; nextfile}' *.gjf

是的，FILENAME是包含正在处理的当前文件名的awk变量。

Answer 2

使用此循环：

for file in *.gjf; do
  echo "FILENAME: $file, " $(sed 's/ /,/;s/$/,/;5q;d' "$file")
done

sed '5q;d'提取第5行

如何使用任何linux工具打印FILENAME前面的每个文件的第（5）行？

2 个答案: