我正在尝试使用pathview（）将我的基因表达覆盖到KEGGS上。这样的事情：
[kegg] [1]
我使用过这段代码：
pv.out＆lt; - pathview（gene.data = merge2，gene.idtype =＆＃34; ENSEMBL＆＃34;，pathway.id =＆＃34; 04110＆＃34;，species =＆＃34; dre＆ ＃34;，out.suffix =＆＃34; ensembl_Cell_cycle＆＃34;，kegg.native = T，same.layer = T）
这是我的数据框结构：
head（merge2）List1_logFC_transformed ENSDARG00000100344 -0.4250000 ENSDARG00000096038 -0.4250000 ENSDARG000000093955 -0.4250000 ENSDARG00000090824 -0.4250000 ENSDARG00000087743 -0.4250000 ENSDARG00000087699 -0.4250000 ENSDARG00000090734 -0.4250000 ENSDARG00000101977 -0.4250000 但是，我收到了这个错误：
UseMethod中的错误（＆＃34;选择_＆＃34;）：没有适用的方法来选择_＆＃39;应用于课程＆＃34; c的对象（＆＃39; OrgDb＆＃39;，＆＃39; AnnotationDb＆＃39;，＆＃39; envRefClass＆＃39;，＆＃39; .environment＆＃39;，＆ ＃39; refClass＆＃39;，＆＃39; environment＆＃39;，＆＃39; refObject＆＃39;，＆＃39; AssayData＆＃39;）＆＃34;注意：没有基因或化合物映射到该途径！参数gene.idtype或cpd.idtype可能是错误的。
有谁知道为什么会这样？今天早上我有这个工作......我不清楚为什么在新机器上这将不再有效！我甚至无法从pathview（）文档中获取示例数据集，当它之前工作时!!
提前致谢
[1]：https://s10.postimg.org/9t02bo4w9/dre04672_ensembl_Intestinal_immune_network_for_I.png
