Question

在下面的bash中，我尝试将/home/cmccabe/QC/test/metrics.txt中的单个文本文件复制3次。然后，使用/home/cmccabe/QC/analysis.txt中的第3-5行（始终相同）重命名3个文本文件中的每一个。但是，我收到一个错误，不知道如何解决它。谢谢你:)。

metrics.txt （tab-delimited）

R_Index ISP Loading Pre-Enrichment  Total Reads Read Length Key Signal  Usable Sequence Enrichment  Polyclonal  Low Quality Test Fragment   Aligned Bases   Unaligned Bases Exception
1   89  .   78402052    201 77  61  98.6    29.2    10.4    79  98.8    1.2

analysis.txt

status: complete
id names: 
00-0000_Last-First
01-0101_LastN-FirstN
02-0202_La-Fi

尝试

LinesToSkip=2
((StartLine=$LinesToSkip+1))

files=($(cat /home/cmccabe/QC/test/metrics.txt ))

i=1

while read -r new_name
do
mv "${files[$i]}" "$new_name"
((i=$i+1))
done < <(sed -n "${StartLine},\$p" /home/cmccabe/QC/analysis.txt)

mv: cannot stat ‘ISP’: No such file or directory
mv: cannot stat ‘Loading’: No such file or directory
mv: cannot stat ‘Pre-Enrichment’: No such file or directory

所需输出（单列数据）

00-0000_Last-First_meterics.txt
01-0101_LastN-FirstN_metrics.txt
02-0202_La-Fi_metrics.txt

Answer 1

您知道，您可以使用sed获取新文件名现在您可以使用printf获取mv命令：

printf "mv metrix.txt %s\n" "$(sed '1,2 d' /home/cmccabe/QC/test/metrics.txt)"

现在输出的输出与<()的常规命令一样。

source <(printf "mv metrix.txt %s\n" "$(sed '1,2 d' /home/cmccabe/QC/test/metrics.txt)")

source可以用点替换，并希望在文件名中看到双引号（可能在其中有空格）：

. <(printf 'mv metrix.txt "%s"\n' "$(sed '1,2 d' /home/cmccabe/QC/test/metrics.txt)")

bash复制文件3次，并使用另一个文件中的行重命名

1 个答案: