我最近开始使用Pandas并且已经在这个问题上磕磕绊绊几天了。我有一个带有间隔信息的数据框,看起来有点像这样:
df = pd.DataFrame({'RangeBegin' : [1,3,5,10,12,42,65],
'RangeEnd' : [2,4,7,11,41,54,100],
'Var1' : ['A','A','A','B','B','B','A'],
'Var2' : ['A','A','B','B','B','B','A']})
RangeBegin RangeEnd Var1 Var2
0 1 2 A A
1 3 4 A A
2 5 7 A B
3 10 11 B B
4 12 41 B B
5 42 54 B B
6 65 100 A A
按RangeBegin排序。我的想法是最终得到这样的东西:
RangeBegin RangeEnd Var1 Var2
0 1.0 4.0 A A
2 5.0 7.0 A B
3 10.0 54.0 B B
6 65.0 100.0 A A
每个"重复" (匹配Var1和Var2)具有连续范围的行被聚合到一行中。我正在考虑扩展此算法以检测和处理重叠,但我希望首先使其正常工作。
你知道,通过使用iterrows逐行构建一个新的数据帧,我得到了一个解决方案,但是我的真实数据集需要太长时间而且我想要使用更多矢量化实施。 我已经查看了groupby,但无法找到一组密钥(或应用于所述组的功能),这将使这项工作成功。
这是我目前的实施情况:
def test():
df = pd.DataFrame({'RangeBegin' : [1,3,5,10,12,42,65],
'RangeEnd' : [2,4,7,11,41,54,100],
'Var1' : ['A','A','A','B','B','B','A'],
'Var2' : ['A','A','B','B','B','B','A']})
print(df)
i = 0
cols = df.columns
aggData = pd.DataFrame(columns = cols)
for row in df.iterrows():
rowIndex, rowData = row
#if our new dataframe is empty or its last row is not contiguous, append it
if(aggData.empty or not duplicateContiguousRow(cols,rowData,aggData.loc[i])):
aggData = aggData.append(rowData)
i=rowIndex
#otherwise, modify the last row
else:
aggData.loc[i,'RangeEnd'] = rowData['RangeEnd']
print(aggData)
def duplicateContiguousRow(cols, row, aggDataRow):
#first bool: are the ranges contiguous?
contiguousBool = aggDataRow['RangeEnd']+1 == row['RangeBegin']
if(not contiguousBool):
return False
#second bool: is this row a duplicate (minus range columns)?
duplicateBool = True
for col in cols:
if(not duplicateBool):
break
elif col not in ['RangeBegin','RangeEnd']:
#Nan != Nan
duplicateBool = duplicateBool and (row[col] == aggDataRow[col] or (row[col]!=row[col] and aggDataRow[col]!=aggDataRow[col]))
return duplicateBool
编辑: This question刚在我写这篇文章时被问到。答案很有希望
答案 0 :(得分:2)
首次检测到consecutive segments:
时,您可以使用groupby
来实现此目的
df['block'] = ((df['Var1'].shift(1) != df['Var1']) | (df['Var2'].shift(1) != df['Var2'])).astype(int).cumsum()
df.groupby(['Var1', 'Var2', 'block']).agg({'RangeBegin': np.min, 'RangeEnd': np.max}).reset_index()
将导致:
Var1 Var2 block RangeBegin RangeEnd
0 A A 1 1 4
1 A A 4 65 100
2 A B 2 5 7
3 B B 3 10 54
然后,您可以按block
排序以恢复原始订单。