熊猫 - 以连续的间隔合并行

时间:2017-03-13 12:09:50

标签: python pandas

我最近开始使用Pandas并且已经在这个问题上磕磕绊绊几天了。我有一个带有间隔信息的数据框,看起来有点像这样:

    df = pd.DataFrame({'RangeBegin' : [1,3,5,10,12,42,65],
               'RangeEnd' : [2,4,7,11,41,54,100],
               'Var1' : ['A','A','A','B','B','B','A'],
               'Var2' : ['A','A','B','B','B','B','A']})

     RangeBegin  RangeEnd Var1 Var2
0           1         2    A    A
1           3         4    A    A
2           5         7    A    B
3          10        11    B    B
4          12        41    B    B
5          42        54    B    B
6          65       100    A    A

按RangeBegin排序。我的想法是最终得到这样的东西:

       RangeBegin  RangeEnd Var1 Var2
0         1.0       4.0    A    A
2         5.0       7.0    A    B
3        10.0      54.0    B    B
6        65.0     100.0    A    A

每个"重复" (匹配Var1和Var2)具有连续范围的行被聚合到一行中。我正在考虑扩展此算法以检测和处理重叠,但我希望首先使其正常工作。

你知道,通过使用iterrows逐行构建一个新的数据帧,我得到了一个解决方案,但是我的真实数据集需要太长时间而且我想要使用更多矢量化实施。 我已经查看了groupby,但无法找到一组密钥(或应用于所述组的功能),这将使这项工作成功。

这是我目前的实施情况:

def test():
    df = pd.DataFrame({'RangeBegin' : [1,3,5,10,12,42,65],
                   'RangeEnd' : [2,4,7,11,41,54,100],
                   'Var1' : ['A','A','A','B','B','B','A'],
                   'Var2' : ['A','A','B','B','B','B','A']})
    print(df)

    i = 0
    cols = df.columns
    aggData = pd.DataFrame(columns = cols)
    for row in df.iterrows():
        rowIndex, rowData = row
        #if our new dataframe is empty or its last row is not contiguous, append it
        if(aggData.empty or not duplicateContiguousRow(cols,rowData,aggData.loc[i])):
            aggData = aggData.append(rowData)
            i=rowIndex
        #otherwise, modify the last row
        else:
            aggData.loc[i,'RangeEnd'] = rowData['RangeEnd']
    print(aggData)

def duplicateContiguousRow(cols, row, aggDataRow):
    #first bool: are the ranges contiguous?
    contiguousBool = aggDataRow['RangeEnd']+1 == row['RangeBegin']
    if(not contiguousBool):
        return False

    #second bool: is this row a duplicate (minus range columns)?
    duplicateBool = True
    for col in cols:
        if(not duplicateBool):
            break
        elif col not in ['RangeBegin','RangeEnd']:
            #Nan != Nan
            duplicateBool = duplicateBool and (row[col] == aggDataRow[col] or (row[col]!=row[col] and aggDataRow[col]!=aggDataRow[col]))
    return duplicateBool

编辑: This question刚在我写这篇文章时被问到。答案很有希望

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

首次检测到consecutive segments

时,您可以使用groupby来实现此目的
df['block'] = ((df['Var1'].shift(1) != df['Var1']) | (df['Var2'].shift(1) != df['Var2'])).astype(int).cumsum()
df.groupby(['Var1', 'Var2', 'block']).agg({'RangeBegin': np.min, 'RangeEnd': np.max}).reset_index()

将导致:

  Var1 Var2  block  RangeBegin  RangeEnd
0    A    A      1           1         4
1    A    A      4          65       100
2    A    B      2           5         7
3    B    B      3          10        54

然后,您可以按block排序以恢复原始订单。

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