我正在尝试将进程替换用于程序的输入文件,但它无法正常工作。是因为某些程序不允许输入文件的进程替换吗?
以下不起作用:
bash -c "cat meaningless_name"
>sequence1
gattacagattacagattacagattacagattacagattacagattacagattaca
>sequence2
gattacagattacagattacagattacagattacagattacagattacagattaca
bash -c "clustalw -align -infile=<(cat meaningless_name) -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
(Less verbose output, finishing with:
No sequences in file. No alignment!
但以下控件确实有效:
bash -c "clustalw -align -infile=meaningless_name -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
(Verbose output, finishing with:
CLUSTAL-Alignment file created [output_alignment.aln]
bash -c "cat <(cat meaningless_name) > meaningless_name2"
diff meaningless_name meaningless_name2
(No output: the two files are the same)
bash -c "clustalw -align -infile=meaningless_name2 -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
(Verbose output, finishing with:
CLUSTAL-Alignment file created [output_alignment.aln]
这表明进程替换本身有效,但是clustalw程序本身并不喜欢进程替换 - 可能是因为它创建了一个非标准文件,或者创建了一个具有异常文件名的文件。
程序不接受流程替换是否常见?我该如何检查这是否是问题?
我在Ubuntu 9.10上运行GNU bash版本4.0.33(1)-release(x86_64-pc-linux-gnu)。 Clustalw是版本2.0.10。
答案 0 :(得分:7)
进程替换会创建一个命名管道。你无法进入命名管道。
答案 1 :(得分:3)
是。我在其他程序中注意到了同样的事情。例如,它在emacs中也不起作用。它给出“文件存在但无法读取”。对于我来说,它绝对是一个特殊的文件/proc/self/fd/some_number
。使用默认设置,less
或most
中的可靠无效。
对大多数人来说:
most <(/bin/echo 'abcdef')
和更短的显示没有。较长的值会截断开头。 less
显然有效,但前提是您指定-f
。
我发现zsh的=
在实践中更有用。除了=
而不是<
之外,它在语法上是相同的。但它只是创建一个临时文件,因此支持不依赖于程序。
编辑:
我发现zsh使用TMPPREFIX
来选择临时文件名。因此,即使您不希望真正的/tmp
为tmpfs
,也可以为zsh安装一个。