有些程序不接受输入文件的进程替换吗?

时间:2010-11-25 06:02:49

标签: bash unix ipc process-substitution

我正在尝试将进程替换用于程序的输入文件,但它无法正常工作。是因为某些程序不允许输入文件的进程替换吗?

以下不起作用:

bash -c "cat meaningless_name"
    >sequence1
    gattacagattacagattacagattacagattacagattacagattacagattaca
    >sequence2
    gattacagattacagattacagattacagattacagattacagattacagattaca
bash -c "clustalw -align -infile=<(cat meaningless_name) -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
    (Less verbose output, finishing with:
    No sequences in file. No alignment!

但以下控件确实有效:

bash -c "clustalw -align -infile=meaningless_name -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
    (Verbose output, finishing with:
    CLUSTAL-Alignment file created  [output_alignment.aln]
bash -c "cat <(cat meaningless_name) > meaningless_name2"
diff meaningless_name meaningless_name2
    (No output: the two files are the same)
bash -c "clustalw -align -infile=meaningless_name2 -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
    (Verbose output, finishing with:
    CLUSTAL-Alignment file created  [output_alignment.aln]

这表明进程替换本身有效,但是clustalw程序本身并不喜欢进程替换 - 可能是因为它创建了一个非标准文件,或者创建了一个具有异常文件名的文件。

程序不接受流程替换是否常见?我该如何检查这是否是问题?

我在Ubuntu 9.10上运行GNU bash版本4.0.33(1)-release(x86_64-pc-linux-gnu)。 Clustalw是版本2.0.10。

2 个答案:

答案 0 :(得分:7)

进程替换会创建一个命名管道。你无法进​​入命名管道。

答案 1 :(得分:3)

是。我在其他程序中注意到了同样的事情。例如,它在emacs中也不起作用。它给出“文件存在但无法读取”。对于我来说,它绝对是一个特殊的文件/proc/self/fd/some_number。使用默认设置,lessmost中的可靠无效。

对大多数人来说:

most <(/bin/echo 'abcdef')

和更短的显示没有。较长的值会截断开头。 less显然有效,但前提是您指定-f

我发现zsh的=在实践中更有用。除了=而不是<之外,它在语法上是相同的。但它只是创建一个临时文件,因此支持不依赖于程序。

编辑:

我发现zsh使用TMPPREFIX来选择临时文件名。因此,即使您不希望真正的/tmptmpfs,也可以为zsh安装一个。