Question

我正在尝试将样本列与两个参考列D和R进行比较。如果样本与D或R匹配，则用D或R替换该数据;除非./。在示例列中，我希望调用是NR。我已经添加了LogicCALL列来演示 - 在我的实际数据数据框中，这些调用将替换（1,0，。/。）

  ReferenceD ReferenceR sample LogicCALL
0          1          0      1         D
1          1          1    ./.        NC
2          1          0      0         R
Index(['ReferenceD', 'ReferenceR', 'sample', 'LogicCALL'], dtype='object')

到目前为止，我已经在下面构建了循环;其中Alt是样本列表。该循环适用于调用D和R而不是NC，而脚本返回＆＃34; R＆＃34;。

for sample in Alt:
      gtdata[(sample)] = np.where((gtdata[(sample)] == gtdata['ReferenceD']) & (gtdata[sample] != gtdata['ReferenceR']), "D",
                                 np.where((gtdata[(sample)] == "D") & (gtdata[(sample)] is not ('\./.')), "D",
                                           np.where((gtdata[(sample)] == "D") & (gtdata[(sample)].str.contains('\./.')), "NC",
                                                   "R")))

Answer 1

这不是一种功能性语法，但最可行的方法是在程序上制作这些语言：

df.loc[df['ReferenceD'].astype(str) == df['sample'], 'LogicCALL'] = 'D'
df.loc[df['ReferenceR'].astype(str) == df['sample'], 'LogicCALL'] = 'R'
df.loc[df['sample'] == './.',                        'LogicCALL'] = 'NR'

numpy condition loop np.where

1 个答案: