我有一个结构定义,其中我有一个动态分配的数组,我需要通过一些OpenMP指令(在C中)将此结构从主机转移到加速器(在我的情况下,它将是一些nvidia GPU) -码)。
struct
如下所示:
struct my_grid {
double **a,
**b,
**c;
};
初始化如下:
initialize_my_grid( struct my_grid *my_gd,
struct grid_config grid_cfg ) {
my_gd->a = matrix_double( grid_cfg.N1.value, grid_cfg.N2.value );
my_gd->b = matrix_double( grid_cfg.N1.value, grid_cfg.N2.value );
my_gd->c = matrix_double( grid_cfg.N1.value, grid_cfg.N2.value );
}
其他struct
grid_config
仅包含一些标量,相关部分如下所示:
struct grid_config {
struct my_variable_size_t
N1, N2;
}
struct my_variable_size_t {
size_t value;
内存分配功能如下(省略NULL错误检查以便于阅读):
double **matrix_double( size_t n_rows, size_t n_cols ) {
size_t ii;
double *arr;
// (c)allocate pointers to rows
arr = calloc( (size_t)n_rows, sizeof(double*) );
// (c)allocate rows and set pointer to cols (?)
arr[0] = calloc( (size_t)(n_rows*n_cols), sizeof(double) );
for ( ii=1 ; ii<n_rows ; ++ii )
arr[ii] = arr[ii-1] + n_cols;
}
在我想在加速器(GPU)上运行的相关循环中,我想我可以做类似的事情
#pragma omp target teams distribute private(jj,kk)
for ( jj=2 ; jj<grid_cfg.N1.value-2 ; jj+=2 ) {
for ( kk=2 ; kk<grid_cfg.N2.value-2 ; kk+=2 ) {
wf_gd->a[jj ][kk ] += wf_gd->b[jj+1][kk ]; // plus additional calculations
}
}
但是当我使用Unsupported OpenACC construct Deep copy -- wf_gd
进行编译时出现编译器错误,例如cc
,这不起作用。
首先,我不明白为什么编译器会提到OpenACC,然后我也想知道是否有可能使用这种数据结构,或者我是否需要在这种情况下摆脱它?
编辑:我试图在CRAY机器上编译它,这对编译器消息很重要,但不应该对一般问题起作用(如何将这样的结构传递给加速器 - 如果它是可能的)。不幸的是我现在可以访问该机器,因此不能提供有关我使用的编译器版本的更多信息 - 但同样,这不应该与一般问题相关(至少在我的理解中)。