Python酸洗错误:TypeError:对象pickle不返回列表

时间:2017-03-06 19:54:22

标签: python pickle astropy astroquery

我知道这个非常古老的问题Python pickling error: TypeError: object pickle not returning list. Issue with numpy?但是给出的唯一答案是相当模糊的。

这是在Python 3.6中重现该问题的代码。

import pickle
from astroquery.irsa import Irsa
from astropy import units as u

# Query region.
table = Irsa.query_region("m31", catalog="fp_psc", spatial="Cone",
                          radius=.5 * u.arcmin)

# Dump table.
with open('table.pkl', 'wb') as f:
    pickle.dump(table, f)

# This is where the issue appears.
with open('table.pkl', 'rb') as f:
    table = pickle.load(f)

当尝试加载pickle数据时,它失败了:

Traceback (most recent call last):
  File "/home/gabriel/Descargas/test.py", line 17, in <module>
    table2 = pickle.load(f)
  File "/home/gabriel/anaconda3/envs/cat-match/lib/python3.6/site-packages/astropy/table/column.py", line 238, in __setstate__
    super_class.__setstate__(self, state)
  File "/home/gabriel/anaconda3/envs/cat-match/lib/python3.6/site-packages/numpy/ma/core.py", line 5869, in __setstate__
    super(MaskedArray, self).__setstate__((shp, typ, isf, raw))
TypeError: object pickle not returning list

我怎样才能解决这个问题?

使用conda,您可以使用以下命令在Python 3环境中安装需求:

conda install astropy
conda install -c astropy astroquery

1 个答案:

答案 0 :(得分:5)

链接的答案提到了numpy蒙面数组在解开它们时造成麻烦。鉴于天体表可能确实具有屏蔽条目(并非每个对象或位置都可能具有例如每个频带或任何相关列的值),这确实可能是您的问题的根源:屏蔽数组。

numpy问题trickers也表明了这个问题:Masked array with object dtype doesn't unpickle。这似乎在pull request 8122中解决了。

搜索release notes for Numpy 1.12.0会在此处显示此拉取请求。因此,除非你已经使用numpy 1.12,否则升级numpy可能是你的价值。