有没有办法在非图形(无视图)模式下运行Cytoscape?

时间:2017-03-05 16:35:04

标签: cytoscape

我正在尝试使用Cytoscape命令行来运行导入和导出网络的脚本,如下所示:

cytoscape.bat -S "script_for_cytoscape.txt"

脚本工作并执行所需的任务,但是,显示Cytoscape,我们可以看到网络和GUI。

我希望在不显示Cytoscape的情况下将其作为后台作业运行。我尝试了“-noView”选项,但它不起作用。

所以我想知道是否有办法在非图形(无视图)模式下运行Cytoscape?

非常感谢你!

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

不幸的是,没有"没有GUI" Cytoscape的模式,所以你需要有一个图形显示。我过去所做的是在ssh中使用X Windows来提供所需的显示,但是从命令脚本驱动所有内容,因此不需要进行任何交互。

- 踏板车