Question

我正在尝试使用rpython从R调用python。效果很好。现在我正在尝试将我的R代码安装到具有4个不同蟒蛇的docker容器中。事实证明configure script允许您指定python版本（RPYTHON_PYTHON_VERSION），但不指定Python的路径。

那么，是否有一个替代R包来从R调用Python？

Answer 1

您可以使用R的system2函数将其作为子进程执行，以执行和捕获输出。

从R执行Python脚本的示例：

# run_splitstr.R
command = "python"

# Note the single + double quotes in the string (needed if paths have spaces)
path2script='"path/to your script/splitstr.py"'

# Build up args in a vector
string = "3523462---12413415---4577678---7967956---5456439"
pattern = "---"
args = c(string, pattern)

# Add path to script as first arg
allArgs = c(path2script, args)

output = system2(command, args=allArgs, stdout=TRUE)

print(paste("The Substrings are:\n", output))

要捕获字符向量中的标准输出（每个元素一行），必须在system2中指定stdout = TRUE，否则只返回退出状态。当stdout = TRUE时，退出状态存储在名为“status”的属性中。

Answer 2

有 reticulate 和 basilisk。我相信只有后者虽然不太成熟，但可以预期同时与多个 python 版本/环境一起工作。

从R调用python的rpython替代方案？

2 个答案: