我很难理解为什么当代码第二次通过while循环时我的for循环被跳过了。第一轮一切都很好。
k = 0
with open("Result.txt", "r") as ParseOutput:
while k < num_lines: # num lines in test file = 12
print("k: " + str(k))
for line in islice(ParseOutput, k, k+100000):
print("k in islice: " + str(k))
field_list = []
fields = line.strip("\n")
fields = fields.split("\t")
field_list.append(fields)
query_plasmid = field_list[0][0]
print("Query Plasmid: " + str(query_plasmid))
l = k
for m, line in enumerate(islice(ParseOutput, l, l+100000)):
if l < 100000:
print("if l: " + str(m))
field_list = []
fields = line.strip("\n")
fields = fields.split("\t")
field_list.append(fields)
next_plasmid = field_list[0][0]
print("Next Plasmid: " + str(next_plasmid) + " l: " + str(l))
if not str(query_plasmid) == str(next_plasmid):
query_plasmid_index = UniqueID_List.index(query_plasmid)
Start_line_list[query_plasmid_index] = k
End_line_list[query_plasmid_index] = m
New_start_line = m+1
print("Start line: " + str(k))
print("End line: " + str(m))
print("New_start_line: " + str(New_start_line))
l = 999999
print("l: " + str(l))
k = k+1
打印命令仅供我控制。以下是脚本的输出:
k: 0
k in islice: 0
Query Plasmid: DA_000001
if l: 0
Next Plasmid: DA_000001 l: 0
if l: 1
Next Plasmid: DA_000001 l: 0
if l: 2
Next Plasmid: DA_000001 l: 0
if l: 3
Next Plasmid: DA_000002 l: 0
Start line: 0
End line: 3
New_start_line: 4
l: 999999
k: 1
k: 2
k: 3
k: 4
k: 5
k: 6
k: 7
k: 8
k: 9
k: 10
k: 11
正如标题所说,我不明白为什么对于k> 0,跳过for循环。感谢您的帮助或任何其他想法!
最佳, 菲利普
PS:我更喜欢有列表的解决方案但不幸的是我的文件非常庞大,我甚至无法枚举行而不会遇到内存错误。因此,硬编码数字的解决方法。
答案 0 :(得分:3)
我认为你从你正在做的第一个循环中读取了整个文件。 因为你达到了filedescriptor&#39; ParseOutput&#39;的EOF,你的for循环都没有任何行可读。
在循环结束时(或根据需要开始),您需要添加:
{"Host":"127.0.0.1.8000", "Connection" : "Keep-alive" ....}
这将使您的文件描述符指向文件的开头。