犰狳:矩阵乘法占用大量内存

时间:2017-02-28 05:48:26

标签: c++ matrix out-of-memory armadillo

我试图使用犰狳进行线性回归,如下面的函数所示:

void compute_weights()
{
    printf("transpose\n");
    const mat &xt(X.t());
    printf("inverse\n");
    mat xd;
    printf("mul\n");
    xd = (xt * X);
    printf("inv\n");
    xd = xd.i();
    printf("mul2\n");
    xd = xd * xt;
    printf("mul3\n");
    W = xd * Y;
}

我把它拆分了,所以我可以看到程序变得如此巨大。矩阵X有64列,超过2300万行。转置并不是太糟糕,但是第一次乘法会导致内存占用完全爆炸。现在,据我所知,如果我乘以X.t()* X,矩阵乘积的每个元素将是X列和X.t()行的点积,结果应该是64x64矩阵。

当然,它应该需要很长时间,但为什么内存会突然爆炸到近30千兆字节?

然后它似乎依旧于那个记忆,然后当它到达第二个倍数时,它太多了,操作系统因为变得如此巨大而杀死它。

有没有办法在没有太多内存使用的情况下计算产品?这个记忆可以回收吗?有没有更好的方法来表示这些计算?

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

除非你使用巨大的工作站,否则你不可能一次性完成整个乘法运算。就像hbrerkere说的那样,你的初始消耗大约是22 GB。所以你要么为此做好准备,要么找到另一种方式。

如果你没有这样的工作站,另一种方法是自己进行乘法,并将其并行化。这是你如何做到的:

  1. 不要将整个矩阵加载到内存中,而是加载部分内容。
  2. 像一百万行X一样加载,并存放在某处。
  3. 加载一百万列Y
  4. 使用std::transform和二元运算符std::multiplies将您加载的部分相乘(这将利用处理器的矢量化,并使其快速),并填写您计算的部分结果。
  5. 加载下一部分矩阵,然后重复
  6. 这不会那么有效,但它会起作用。另一种选择是在将矩阵分解为较小的矩阵后考虑使用Armadillo,其乘法将产生子结果。

    由于两个原因,两种方法都比完全乘法慢得多:

    1. 从内存加载和删除数据的开销
    2. 矩阵乘法已经是一个O(N ^ 3)问题......现在拆分你的乘法就是O(N ^ 2),所以它会变成O(N ^ 6)......
    3. 祝你好运!

答案 1 :(得分:1)

您可以使用QR分解使用更少的内存来计算权重(您可能希望查找最小二乘QR');

简言之: 使用户主转换(隐式)找到正交Q,以便

Q'*X = R where R is upper triangular

并同时转换Y

Q'*Y = y

解决

R*y = W for W using only the top 64 rows of R and y

如果你愿意覆盖Z和Y,那么这不需要额外的内存;否则你需要一份X副本和一份Y.