我试图使用犰狳进行线性回归,如下面的函数所示:
void compute_weights()
{
printf("transpose\n");
const mat &xt(X.t());
printf("inverse\n");
mat xd;
printf("mul\n");
xd = (xt * X);
printf("inv\n");
xd = xd.i();
printf("mul2\n");
xd = xd * xt;
printf("mul3\n");
W = xd * Y;
}
我把它拆分了,所以我可以看到程序变得如此巨大。矩阵X有64列,超过2300万行。转置并不是太糟糕,但是第一次乘法会导致内存占用完全爆炸。现在,据我所知,如果我乘以X.t()* X,矩阵乘积的每个元素将是X列和X.t()行的点积,结果应该是64x64矩阵。
当然,它应该需要很长时间,但为什么内存会突然爆炸到近30千兆字节?
然后它似乎依旧于那个记忆,然后当它到达第二个倍数时,它太多了,操作系统因为变得如此巨大而杀死它。
有没有办法在没有太多内存使用的情况下计算产品?这个记忆可以回收吗?有没有更好的方法来表示这些计算?
答案 0 :(得分:1)
除非你使用巨大的工作站,否则你不可能一次性完成整个乘法运算。就像hbrerkere说的那样,你的初始消耗大约是22 GB。所以你要么为此做好准备,要么找到另一种方式。
如果你没有这样的工作站,另一种方法是自己进行乘法,并将其并行化。这是你如何做到的:
std::transform
和二元运算符std::multiplies
将您加载的部分相乘(这将利用处理器的矢量化,并使其快速),并填写您计算的部分结果。这不会那么有效,但它会起作用。另一种选择是在将矩阵分解为较小的矩阵后考虑使用Armadillo,其乘法将产生子结果。
由于两个原因,两种方法都比完全乘法慢得多:
答案 1 :(得分:1)
您可以使用QR分解使用更少的内存来计算权重(您可能希望查找最小二乘QR');
简言之: 使用户主转换(隐式)找到正交Q,以便
Q'*X = R where R is upper triangular
并同时转换Y
Q'*Y = y
解决
R*y = W for W using only the top 64 rows of R and y
如果你愿意覆盖Z和Y,那么这不需要额外的内存;否则你需要一份X副本和一份Y.