交互式地将点添加到plotly R中的子图,而不重绘背景图

时间:2017-02-26 15:18:40

标签: javascript r plotly onrender

这是上一篇文章(Interactively adding points to plotly R without redrawing background plot)的延续。我正在制作一个32 mtcars数据集值的散点图矩阵(使用R包ggpairs)。我的目标是允许用户点击任何子图中的一个点。这将导致原始数据帧中的行的随机子集(大小可以变化,但在下面的示例中为2)将在所有散点图子图中重叠(散点图的数量可以变化,但在下面的示例中为3)。 / p>

我的半工作MWE如下 -

library(plotly)
library(htmlwidgets)
library(GGally)

dat <- mtcars[,c(3,4,7)]
dat[,3] = dat[,3]*8

p <- ggpairs(dat)

myMax = max(abs(dat))
myMin = min(abs(dat))
myRange = c(myMax, myMin)

p2 <- p
for(x in 2:p$nrow) {
  for(y in 1:(x-1)) {
    p2[x,y] <- p[x,y] +
      coord_cartesian(xlim = c(myRange), ylim = c(myRange))
  }
}

p3 <- ggplotly(p2)

p3 %>% onRender("function(el, x, data) {

    // Number of rows in data frame is myLength=3
    myLength = Math.sqrt(document.getElementsByClassName('cartesianlayer')[0].childNodes.length);

    // AxisNames stores the names of the 3 rows ('disp','hp','qsec')
    AxisNames = [];
    for (i = 1; i < (myLength+1); i++) {
      AxisNames.push(document.getElementsByClassName('infolayer')[0].childNodes[i].textContent);
    }

    el.on('plotly_click', function(e) {
      // Grab two random rows of the 32 rows from mtcars dataset and store in myData. In my real code (not this MWE), myData represents an array of 1 or more objects, where each object contains values for each column in the dataset.
      data1 = data[Math.floor(Math.random() * 32) + 1];
      data2 = data[Math.floor(Math.random() * 32) + 1];
      var myData = [data1, data2];

      //May not be necessary, but this creates one array allData that contains all column values for all randomly selected rows. Since this example has 3 columns (disp, hp, and qsec) and two randomly selected rows, allData has a length of 6.
      var allData = [];
      for (i = 0; i < myData.length; i++){
        for (j = 0 ; j < myLength; j++){
          allData.push(myData[i][AxisNames[j]])
        }
      }
      console.log(allData)

      //This correctly plots the disp on the x-axis and qsec on the y-axis of both randomly selected data frame rows and plots it into the correct scatterplot (bottom left one that has x-axis of disp and y-axis of qsec). This needs to be automated, so that the corresponding x and y values for the 2 randomly selected data frame rows are also plotted on all other scatterplot matrices.
      var trace1 = {
      x: [allData[0], allData[3]],
      y: [allData[2], allData[5]],
      mode: 'markers',
      marker: {
      color: 'green',
      size: 20
      }
      };

      Plotly.addTraces(el.id, trace1);
      }
      )}", data = dat)

当前发生的是随机选择的行仅在左下角的一个子图中(而不是在所有三个散点图中)绘制(绿色)。我很难访问和绘制左下角旁边的任何其他散点图。

ScatMatrix

我可能正在使用更长的数据框(按数千行观察的顺序)和更宽的数据框(超过三列,导致绘制三个以上的散点图)的方法。所以,我试图找到一种有效的方法来实现这个目标,这样点数不需要太长时间来绘制。我相信(从阅读中)每个Plotly.addTraces()都可以减慢绘图时间。如果数据框有6列,则会有15个散点图,如果每个散点图都有自己的addTraces(),则会有15个addTraces()。我想知道这是否会使点的绘图太慢?如果是这样,我会非常渴望听到关于如何最有效地实现这一目标的建议(允许在所有散点图上尽可能快地绘制绿点)。

我会非常感谢任何帮助或想法!

编辑:

感谢NicE的输入,我能够更新这个脚本,这样就不需要对每个子图中使用的轴标签和变量进行硬编码。更新的MWE如下:

library(plotly)
library(htmlwidgets)
library(GGally)

dat <- mtcars[,c(3,4,7)]
dat[,3] = dat[,3]*8

p <- ggpairs(dat)

myMax = max(abs(dat))
myMin = min(abs(dat))
myRange = c(myMax, myMin)

p2 <- p
for(x in 2:p$nrow) {
  for(y in 1:(x-1)) {
    p2[x,y] <- p[x,y] +
      coord_cartesian(xlim = c(myRange), ylim = c(myRange))
  }
}

p3 <- ggplotly(p2)

p3 %>% onRender("function(el, x, data) {

                len = Math.sqrt(document.getElementsByClassName('cartesianlayer')[0].childNodes.length);

                // AxisNames stores the names of the 3 rows ('disp','hp','qsec')
                AxisNames = [];
                for (i = 1; i < (len+1); i++) {
                AxisNames.push(document.getElementsByClassName('infolayer')[0].childNodes[i].textContent);
                }

                el.on('plotly_click', function(e) {
                  data1 = data[Math.floor(Math.random() * 32) + 1];
                  data2 = data[Math.floor(Math.random() * 32) + 1];
                  var myData = [data1, data2];
                  console.log(myData);

                  var Traces = [];
                  var i=0;
                  var k=1;
                  while ((i*len+k)<=Math.pow((len-1),2)) {
                        var xArr = [];
                        for (a=0; a<myData.length; a++){
                          xArr.push(myData[a][AxisNames[i]])
                        }
                    while ((i+k)<len){
                        var yArr = [];
                        for (a=0; a<myData.length; a++){
                          yArr.push(myData[a][AxisNames[(len-k)]])
                        }

                      var trace = {
                        x: xArr,
                        y: yArr,
                        mode: 'markers',
                        marker: {
                          color: 'green',
                          size: 20
                        },
                        xaxis: 'x' + (i+1),
                        yaxis: 'y' + (i*len+k)
                      };
                      Traces.push(trace);
                      k++;
                    }
                    i++;
                    k=1;
                  }
                  Plotly.addTraces(el.id, Traces);
                }
                )}", data = dat)

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

您可以在跟踪中添加xaxisyaxis,以指定需要添加跟踪的图。

在您的情况下,第一列的xaxisx,第二列为x2,第三列为x3。左下图的yaxisy,上升时间为y2,第一列的前一个为y3,然后为{ {1}}用于中间柱底图等...

例如,您可以在y4

中执行此操作
onRender