我是R的新手,希望将文件列表作为单独的数据框读取,对每个文件执行多个操作,并将它们保存为具有动态文件名的单独文件。我在想我应该使用lappy,但不确定。
以下是我编写的适用于一个文件的代码:
df <- read.fwf('USC00011084.dly', widths = c(21, rep(c(5, 1, 1, 1),31)))
df2 <- df[-c(3:5, 7:9, 11:13, 15:17, 19:21, 23:25, 27:29, 31:33, 35:37, 39:41, 43:45, 47:49, 51:53, 55:57, 59:61, 63:65, 67:69, 71:73, 75:77, 79:81, 83:85, 87:89, 91:93, 95:97, 99:101, 103:105, 107:109, 111:113, 115:117, 119:121, 123:125)]
df2[df2=="-9999"]<-NA
df$new <- rowSums(df2[,2:32], na.rm = TRUE)
df2["Total"] <- df$new
colnames(df2) <- c("StationDateType", "1", "2", "3", "4", "5", "6", "7", "8", "9", "10", "11", "12", "13", "14", "15", "16", "17", "18", "19", "20", "21", "22", "23", "24", "25", "26", "27", "28", "28", "30", "31", "TotalMonthly")
Prcp <- df2[grep("PRCP", df2$StationDateType),]
write.table(Prcp, "USC00011084Prcp.txt", sep="\t", row.names=FALSE)
如何为目录中的文件列表执行此操作?有任何想法吗?谢谢。
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你可以尝试这个...... 您可以获取文件列表:
files <- list.files(getwd())
编写一个执行所需分析的函数,并将结果写入表中,就像您所做的那样。这里我们使用tools :: file_path_sans_ext来提取文件名(没有文件类型扩展名),最后使用它来命名要保存到txt的表。
myFunction <- function(files){
fileName <- tools::file_path_sans_ext(files)
df <- read.fwf(files, widths = c(21, rep(c(5, 1, 1, 1),31)))
# rest of your code
# ...
write.table(Prcp, paste0(fileName, "Prcp.txt"), sep="\t", row.names=FALSE)
}
您可以使用lapply在文件中的每个文件上运行您的函数。
lapply(files, function(x) myFunction(x))