R中SPS数据的质量控制

Question

我有一个包含SNP（基因型）的大数据集，分别是501行和42844列。

数据是这样的：

 OAR19_64675012.1 OAR19_64803054.1 OAR1_88143.1 s09912.1 s36301.1 s34880.1
           AB               AB           BB       BB       AA       AA
           AB               AB           AB       AA       AB       AB
           AB               AB           BB       AB       BB       AA
           AA               BB           BB       AB       AA       AA

我在质量控制过程中遇到了很大的问题。 我在R中使用QCGWAS库，当我点击命令以启动质量控制时：

  headers<- names(snp) ## names of the columns, snp is the dataframe above

  # make them as a dataframe with characters
  h_data<- as.character(data.frame(headers , stringsAsFactors = F))


new_data <- QC_GWAS(filename = "data1.txt",   # command for QC data1.txt is my snps data 
                 header_translations = h_data,
                 save_final_dataset = TRUE)

我收到此错误：

Error: file.exists(paste(dir_references, header_translations, sep = "/")) is not TRUE

我不知道自己要做什么......我一直在寻找东西，但我一直都会遇到错误......我尝试按照/中的快速入门指南进行操作R / library / QCGWAS / doc，但我得到了错误。

如果有人有想法和时间来帮助我，我会想到这一点。为了继续这个项目，解决这个问题对我来说非常重要。我使用过其他一些图书馆，但我无法处理质量控制，因为他们没有给我干净的数据。