Python:将列向量转换为.xyz文件格式

时间:2017-02-23 12:44:28

标签: python-2.7

我有一个分子几何的列矢量,格式为

x1
y1
z1
x2
y2
z2
x3
y3
z3
x4
y4
z4
x5
y5
z5
x6
y6
z6
x7
y7
z7
x8
y8
z8

我想将其转换为.xyz文件格式:

number of atoms
comment line
C x1 y1 z1
H x2 y2 z2
H x3 y3 z3
C x4 y4 z4
H x5 y5 z5
H x6 y6 z6
O x7 y7 z7
O x8 y8 z8

这很容易吗?如果添加原子类型很困难,那么只需将坐标重新排列到列中就可以了(至少可以减少手工劳动量)。

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