使用envfit与R

Question

在纯素包中使用envfit时，每个参数的大小是否重要？

我有两个数据帧：

bwsp：无脊椎动物的丰度

bwenv：五个环境参数（距离，深度，流量，叶绿素，褐藻素）

我的三个参数具有相似的幅度，而另外两个则小2-3个数量级。较小的参数不会出现在MDS图上。

m <- metaMDS(bwsp)
ef <- envfit(m, bwenv, perm = 1000, na.rm = TRUE)
ef
plot(m)
plot(ef, add = T, p. = 0.05) 

Answer 1

envfit基于相关性，原始幅度不会影响其结果。但是，您在绘图中指定了 P - 值限制p. = 0.05，这可能会删除一些变量。

这是猜测，因为你没有提供可重复的例子。