Apache Spark(PySpark)在以CSV格式读取时处理空值

时间:2017-02-19 23:49:28

标签: python csv apache-spark pyspark

我正在尝试从交通部读取飞行数据。它以CSV格式存储,并继续获取java.lang.NumberFormatException: null

我尝试将nanValue设置为空字符串,因为它的默认值为NaN,但这不起作用。

我目前的代码是:

spark = SparkSession.builder \
    .master('local') \
    .appName('Flight Delay') \
    .getOrCreate()

schema = StructType([
    StructField('Year', IntegerType(), nullable=True),
    StructField('Month', IntegerType(), nullable=True),
    StructField('Day', IntegerType(), nullable=True),
    StructField('Dow', IntegerType(), nullable=True),
    StructField('CarrierId', StringType(), nullable=True),
    StructField('Carrier', StringType(), nullable=True),
    StructField('TailNum', StringType(), nullable=True),
    StructField('Origin', StringType(), nullable=True),
    StructField('Dest', StringType(), nullable=True),
    StructField('CRSDepTime', IntegerType(), nullable=True),
    StructField('DepTime', IntegerType(), nullable=True),
    StructField('DepDelay', DoubleType(), nullable=True),
    StructField('TaxiOut', DoubleType(), nullable=True),
    StructField('TaxiIn', DoubleType(), nullable=True),
    StructField('CRSArrTime', IntegerType(), nullable=True),
    StructField('ArrTime', IntegerType(), nullable=True),
    StructField('ArrDelay', DoubleType(), nullable=True),
    StructField('Cancelled', DoubleType(), nullable=True),
    StructField('CancellationCode', StringType(), nullable=True),
    StructField('Diverted', DoubleType(), nullable=True),
    StructField('CRSElapsedTime', DoubleType(), nullable=True),
    StructField('ActualElapsedTime', DoubleType(), nullable=True),
    StructField('AirTime', DoubleType(), nullable=True),
    StructField('Distance', DoubleType(), nullable=True),
    StructField('CarrierDelay', DoubleType(), nullable=True),
    StructField('WeatherDelay', DoubleType(), nullable=True),
    StructField('NASDelay', DoubleType(), nullable=True),
    StructField('SecurityDelay', DoubleType(), nullable=True),
    StructField('LateAircraftDelay', DoubleType(), nullable=True)
])

flts = spark.read \
    .format('com.databricks.spark.csv') \
    .csv('/home/william/Projects/flight-delay/data/201601.csv',
         schema=schema, nanValue='', header='true')

以下是我正在使用的CSV:http://pastebin.com/waahrgqB

最后一行有中断并提升java.lang.NumberFormatException: null

似乎有些数字列是空字符串,而其他数据列只是空字符串。有人可以帮帮我吗?

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

感谢KiranM的建议,我找到了解决方案。我让Spark推断出架构(一切都设置为String),然后手动设置我想要的数字列。

以下是代码:

from pyspark.sql import (SQLContext,
                     SparkSession)

from pyspark.sql.types import (StructType,
                           StructField,
                           DoubleType,
                           IntegerType,
                           StringType)

spark = SparkSession.builder \
    .master('local') \
    .appName('Flight Delay') \
    .getOrCreate()


flts = spark.read \
    .format('com.databricks.spark.csv') \
    .csv('/home/william/Projects/flight-delay/data/merged/2016.csv',
         inferSchema='true', nanValue="", header='true', mode='PERMISSIVE')


flts = flts \
    .withColumn('Year', flts['Year'].cast('int')) \
    .withColumn('Month', flts['Month'].cast('int')) \
    .withColumn('Day', flts['Day'].cast('int')) \
    .withColumn('Dow', flts['Dow'].cast('int')) \
    .withColumn('CRSDepTime', flts['CRSDepTime'].cast('int')) \
    .withColumn('DepTime', flts['DepTime'].cast('int')) \
    .withColumn('DepDelay', flts['DepDelay'].cast('int')) \
    .withColumn('TaxiOut', flts['TaxiOut'].cast('int')) \
    .withColumn('TaxiIn', flts['TaxiIn'].cast('int')) \
    .withColumn('CRSArrTime', flts['CRSArrTime'].cast('int')) \
    .withColumn('ArrTime', flts['ArrTime'].cast('int')) \
    .withColumn('ArrDelay', flts['ArrDelay'].cast('int')) \
    .withColumn('Cancelled', flts['Cancelled'].cast('int')) \
    .withColumn('Diverted', flts['Diverted'].cast('int')) \
    .withColumn('CRSElapsedTime', flts['CRSElapsedTime'].cast('int')) \
    .withColumn('ActualElapsedTime', flts['ActualElapsedTime'].cast('int')) \
    .withColumn('AirTime', flts['AirTime'].cast('int')) \
    .withColumn('Distance', flts['Distance'].cast('int')) \
    .withColumn('CarrierDelay', flts['CarrierDelay'].cast('int')) \
    .withColumn('WeatherDelay', flts['WeatherDelay'].cast('int')) \
    .withColumn('NASDelay', flts['NASDelay'].cast('int')) \
    .withColumn('SecurityDelay', flts['SecurityDelay'].cast('int')) \
    .withColumn('LateAircraftDelay ', flts['LateAircraftDelay '].cast('int'))

也许我可以把它放到一个循环中,但我现在要用它来运行。

答案 1 :(得分:0)

问题在于数字类型列具有空字符串(使用“”而不是空白数据)。

然后一个选项是将数据读取为StringType列,然后将该列类型转换为相关类型(例如:int)。这样它就不会影响其他列数据。

StructField('CRSDepTime', StringType(), nullable=True),


flts.withColumn('CRSDepTime', flts['CRSDepTime'].cast("int")) \
    .printSchema()

这可以解决您的问题。