Question

我经常发现自己编写的R脚本会产生大量输出。我发现把这个输出放到它自己的目录中更干净。我在下面写的内容将检查目录是否存在并移入其中，或创建目录然后移入其中。有没有更好的方法来解决这个问题？

mainDir <- "c:/path/to/main/dir"
subDir <- "outputDirectory"

if (file.exists(subDir)){
    setwd(file.path(mainDir, subDir))
} else {
    dir.create(file.path(mainDir, subDir))
    setwd(file.path(mainDir, subDir))

}

Answer 1

使用showWarnings = FALSE：

dir.create(file.path(mainDir, subDir), showWarnings = FALSE)
setwd(file.path(mainDir, subDir))

如果目录已经存在，

dir.create()不会崩溃，它只会打印出警告。因此，如果您能够看到警告，那么只需执行此操作即可：

dir.create(file.path(mainDir, subDir))
setwd(file.path(mainDir, subDir))

Answer 2

截至2015年4月16日，随着R 3.2.0的发布，有一个名为dir.exists()的新功能。要使用此功能并创建目录（如果它不存在），您可以使用：

ifelse(!dir.exists(file.path(mainDir, subDir)), dir.create(file.path(mainDir, subDir)), FALSE)

如果目录已存在或不可创建，则返回FALSE;如果目录不存在但成功创建，则返回TRUE。

请注意，只需检查目录是否存在，即可使用

dir.exists(file.path(mainDir, subDir))

Answer 3

就通用架构而言，我建议在目录创建方面采用以下结构。这将涵盖大多数潜在问题，dir.create调用将检测到目录创建的任何其他问题。

mainDir <- "~"
subDir <- "outputDirectory"

if (file.exists(paste(mainDir, subDir, "/", sep = "/", collapse = "/"))) {
    cat("subDir exists in mainDir and is a directory")
} else if (file.exists(paste(mainDir, subDir, sep = "/", collapse = "/"))) {
    cat("subDir exists in mainDir but is a file")
    # you will probably want to handle this separately
} else {
    cat("subDir does not exist in mainDir - creating")
    dir.create(file.path(mainDir, subDir))
}

if (file.exists(paste(mainDir, subDir, "/", sep = "/", collapse = "/"))) {
    # By this point, the directory either existed or has been successfully created
    setwd(file.path(mainDir, subDir))
} else {
    cat("subDir does not exist")
    # Handle this error as appropriate
}

另请注意，如果~/foo不存在，那么除非您指定dir.create('~/foo/bar')，否则对recursive = TRUE的调用将失败。

Answer 4

使用file.exists（）来测试目录是否存在是原始帖子中的问题。如果subDir包含现有文件的名称（而不仅仅是路径），则file.exists（）将返回TRUE，但是对setwd（）的调用将失败，因为您无法将工作目录设置为指向文件。

我建议使用file_test（op =＆＃34; -d＆＃34;，subDir），它将返回＆＃34; TRUE＆＃34;如果subDir是现有目录，但如果subDir是现有文件或不存在的文件或目录，则为FALSE。同样，检查文件可以使用op =＆＃34; -f＆＃34;。

完成

此外，如另一条评论中所述，工作目录是R环境的一部分，应由用户控制，而不是脚本。理想情况下，脚本应该不会改变R环境。为了解决这个问题，我可能会使用options（）来存储一个全局可用的目录，我想要所有的输出。

因此，请考虑以下解决方案，其中someUniqueTag只是程序员定义的选项名称前缀，这使得不太可能存在具有相同名称的选项。（例如，如果您正在开发名为＆＃34; filer＆＃34;的包，则可以使用filer.mainDir和filer.subDir）。

以下代码将用于设置稍后可在其他脚本中使用的选项（从而避免在脚本中使用setwd（）），并在必要时创建文件夹：

mainDir = "c:/path/to/main/dir"
subDir = "outputDirectory"

options(someUniqueTag.mainDir = mainDir)
options(someUniqueTag.subDir = "subDir")

if (!file_test("-d", file.path(mainDir, subDir)){
  if(file_test("-f", file.path(mainDir, subDir)) {
    stop("Path can't be created because a file with that name already exists.")
  } else {
    dir.create(file.path(mainDir, subDir))
  }
}

然后，在任何需要操作subDir文件的后续脚本中，您可能会使用以下内容：

mainDir = getOption(someUniqueTag.mainDir)
subDir = getOption(someUniqueTag.subDir)
filename = "fileToBeCreated.txt"
file.create(file.path(mainDir, subDir, filename))

此解决方案将工作目录保留在用户的控制之下。

Answer 5

以下是简单检查，，如果不存在，则创建目录

## Provide the dir name(i.e sub dir) that you want to create under main dir:
output_dir <- file.path(main_dir, sub_dir)

if (!dir.exists(output_dir)){
dir.create(output_dir)
} else {
    print("Dir already exists!")
}

Answer 6

我遇到了R 2.15.3的问题，在尝试在共享网络驱动器上递归创建树结构时，我会收到权限错误。

为了克服这种奇怪现象，我手动创建结构;

mkdirs <- function(fp) {
    if(!file.exists(fp)) {
        mkdirs(dirname(fp))
        dir.create(fp)
    }
} 

mkdirs("H:/foo/bar")

Answer 7

要查明路径是否是有效目录，请尝试：

file.info(cacheDir)[1,"isdir"]

file.info并不关心最后的斜线。

如果目录以斜杠结尾，则Windows上的

file.exists将失败，如果没有它，则成功。因此，这不能用于确定路径是否是目录。

file.exists("R:/data/CCAM/CCAMC160b_echam5_A2-ct-uf.-5t05N.190to240E_level1000/cache/")
[1] FALSE

file.exists("R:/data/CCAM/CCAMC160b_echam5_A2-ct-uf.-5t05N.190to240E_level1000/cache")
[1] TRUE

file.info(cacheDir)["isdir"]

Answer 8

单线：

if (!dir.exists(output_dir)) {dir.create(output_dir)}

示例：

dateDIR <- as.character(Sys.Date())
outputDIR <- file.path(outD, dateDIR)
if (!dir.exists(outputDIR)) {dir.create(outputDIR)}

Answer 9

我知道这个问题是在不久前提出的，但如果有用，here 包对于不必引用特定文件路径和使代码更具可移植性非常有帮助。它会自动将您的工作目录定义为您的 .Rproj 文件所在的目录，因此以下通常就足够了，而无需定义工作目录的文件路径：

library(here)

if (!dir.exists(here(outputDir))) {dir.create(here(outputDir))}

检查目录是否存在，如果不存在则创建

9 个答案: