Question

我的系统上有CentOS release 6.8 (Final)。我把igrph-python安装了

conda install -c marufr python-igraph=0.7.1.post6

当我尝试导入包时，我收到错误：

ImportError: /lib64/libc.so.6: version `GLIBC_2.14' not found (required by /home/abolfazl/.python-eggs/python_igraph-0.7.1.post6-py2.7-linux-x86_64.egg-tmp/igraph/_igraph.so)

我搜索了类似的问题，并找到了一些答案。我尝试过this one。但是，我仍然得到ImportError。你有什么解决方案吗？非常感谢

Answer 1

TL; DR：

conda install -yc nehaljwani python-igraph=0.7.1.post6

好的，让我们看看共享库存在哪些版本化依赖项：

readelf --version-info /root/.cache/Python-Eggs/python_igraph-0.7.1.post6-py2.7-linux-x86_64.egg-tmp/igraph/_igraph.so | grep -Po '(?<=GLIBC_)([\d.]*)' | sort -Vr | head -1
2.14

readelf --version-info /root/.cache/Python-Eggs/python_igraph-0.7.1.post6-py2.7-linux-x86_64.egg-tmp/igraph/_igraph.so | grep -Po '(?<=GLIBCXX_)([\d.]*)' | sort -Vr | head -1
3.4.15

让我们看一下系统提供的内容：

strings /lib64/libc.so.6  | grep -Po '(?<=GLIBC_)([\d.]*)' | sort -Vr | head -1
2.12

strings /usr/lib64/libstdc++.so.6 | grep -Po '(?<=GLIBCXX_)([\d.]*)' | sort -Vr | head -1
3.4.13

如您所见，3.4.13是＆lt; 3.4.15和2.12是＆lt; 2.14因此共享库_igraph.so无法加载。

好的，所以你有一些选择：

备选方案1：使用conda的gcc和libxml2构建来构建软件包。

yum install -y gcc-c++ libxml2-devel
bash Miniconda2-4.2.12-Linux-x86_64.sh -b -p ~/m2
source ~/m2/bin/activate
conda install -y conda-build
conda install -yc marufr python-igraph=0.7.1.post6
conda install -y gcc libxml2
export LD_LIBRARY_PATH=~/m2/lib/
conda build $CONDA_PREFIX/pkgs/python-igraph-0.7.1.post6-py27_0/info/recipe/
conda remove -y python-igraph
conda install $CONDA_PREFIX/conda-bld/linux-64/python-igraph-0.7.1.post6-py27_0.tar.bz2
python -c 'import igraph; print igraph.__version__'
0.7.1

请注意，我在conda中使用了gcc，我必须设置LD_LIBRARY_PATH，这样在测试包时，它会选择$CONDA_PREFIX/lib/libstdc++.so而不是系统{{1} }。因此，下次您使用自己构建的软件包时，也必须使用conda安装libstdc++.so。呃，工作太多了。

备选方案2：构建软件包，但使用system＆＃39; s gcc和libxml2

gcc

请注意，这一次，我没有必要导出yum install -y gcc-c++ libxml2-devel bash Miniconda2-4.2.12-Linux-x86_64.sh -b -p ~/m2 source ~/m2/bin/activate conda install -y conda-build conda install -yc marufr python-igraph=0.7.1.post6 conda build $CONDA_PREFIX/pkgs/python-igraph-0.7.1.post6-py27_0/info/recipe/ conda remove -y python-igraph conda install $CONDA_PREFIX/conda-bld/linux-64/python-igraph-0.7.1.post6-py27_0.tar.bz2 python -c 'import igraph; print igraph.__version__' 0.7.1并依赖旧的系统库。现在，每次使用此软件包时，您都不需要使用conda安装LD_LIBRARY_PATH。但是，工作太多了，嗯。

备选方案3.让pip执行共享库的编译：{{1}}

gcc

备选方案4：我已经为您构建了包并将其放在我的频道上。随意使用它： - ）

_igraph.so

备选方案4是目前最简单的，但为什么它有效？现在让我们看一下它的依赖关系：

yum install -y gcc-c++ libxml2-devel
bash Miniconda2-4.2.12-Linux-x86_64.sh -b -p ~/m2
source ~/m2/bin/activate
pip install python-igraph==0.7.1.post6
python -c 'import igraph; print igraph.__version__'
0.7.1

如您所见，bash Miniconda2-4.2.12-Linux-x86_64.sh -b -p ~/m2 source ~/m2/bin/activate conda install -yc nehaljwani python-igraph=0.7.1.post6 python -c 'import igraph; print igraph.__version__' 0.7.1是＆lt; readelf --version-info /root/.cache/Python-Eggs/python_igraph-0.7.1.post6-py2.7-linux-x86_64.egg-tmp/igraph/_igraph.so | grep -Po '(?<=GLIBCXX_)([\d.]*)' | sort -Vr | head -1 3.4 readelf --version-info /root/.cache/Python-Eggs/python_igraph-0.7.1.post6-py2.7-linux-x86_64.egg-tmp/igraph/_igraph.so | grep -Po '(?<=GLIBC_)([\d.]*)' | sort -Vr | head -1 2.7和3.4是＆lt; 3.4.15因此共享库2.7现在加载了系统的旧库： - ）

导入igraph-python的麻烦

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