我已经实现了一个显微镜，它可以获取样本中不同切片（z方向）的图像。为了提高采集速度，焦平面的变化和采集运行（或多或少）独立：由照明光和焦平面的位置定义的焦平面由NI-DAQ卡驱动。相机由软件触发。 系统持续获取，这意味着
因此，理想地，通过使用完整序列的每个第20个图像来实现仅由一个位置组成的图像序列。总序列包含多达15000张图像。这些由20个不同的切片/位置组成。
不幸的是，系统未准确同步。通过使用建议的方法，在几分钟内实验中的位置略微漂移。
我正在以更好的同步方式并行工作，但由于我已经完成了重要的实验，因此找到一种可以减少这种“漂移”的重建方法会很棒。影响。 我已经尝试过使用光线和焦平面的驱动信号，采集的时间标记，甚至使用焦点测量。
我正在考虑的是模式匹配，以找到每个平面的最佳匹配。在最好的情况下，算法应该是健壮且快速的。
有人有建议或其他经验可以分享吗？顺便说一句，我使用Matlab，但这是一个普遍的问题。