在stat_contour中设置特定于构面的中断

时间:2017-02-08 01:25:16

标签: r ggplot2

我希望使用ggplotstat_contourfacet_grid的两类数据显示等高线图。我想基于数据突出显示特定级别。这是使用通常volcano数据的类似虚拟示例。

library(dplyr)
library(ggplot2)    
v.plot <- volcano %>% reshape2::melt(.) %>% 
      mutate(dummy = Var1 > median(Var1)) %>% 
      ggplot(aes(Var1, Var2, z = value)) + 
      stat_contour(breaks = seq(90, 200, 12)) + 
      facet_grid(~dummy)

剧情1: enter image description here

让我们说在每个因素水平(我估计东西两半),我想找到火山的平均高度并显示出来。我可以手动计算:

volcano %>% reshape2::melt(.) %>% 
  mutate(dummy = Var1 > median(Var1)) %>% 
  group_by(dummy) %>% 
  summarise(h.bar = mean(value))

# A tibble: 2 × 2
  dummy    h.bar
  <lgl>    <dbl>
1 FALSE 140.7582
2  TRUE 119.3717

这告诉我,每一半的平均高度分别为141和119.我可以同时绘制两个方面的平均值,但不是每一方都适当的那些。

v.plot + stat_contour(breaks = c(141, 119), colour = "red", size = 2)

剧情2: enter image description here

并且您无法将breaks=放入aes()语句中,因此将其作为原始数据框中的列传递出来。我意识到这个虚拟的例子我可能只是做bins=2之类的事情但是在我的实际数据中我不想要数据的意思,我想要其他的东西。

谢谢!

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

我再次尝试解决这个问题并提出了部分解决方案,但我不得不使用其他geom

volcano %>% reshape2::melt(.) %>% 
  mutate(dummy = Var1 > median(Var1)) %>% 
  group_by(dummy) %>% 
  mutate(h.bar = mean(value),                      # edit1
         is.close = round(h.bar) == value) %>%     #
  ggplot(aes(Var1, Var2, z = value)) + 
  stat_contour(breaks = seq(90, 200, 12)) + 
  geom_point(colour = "red", size = 3,             # edit 2
           aes(alpha = is.close)) +                #
  scale_alpha_discrete(range = c(0,1)) +           #
  facet_grid(~dummy)

edit 1中,我在上面的块中添加了mutate(),以生成一个变量,用于标识value“足够接近”(四舍五入到最接近的整数)到所需高光点的位置(这个例子的数据的平均值。)

edit2中,我添加了geom_point来显示具有所需值的网格位置,并使用alpha 0或完全透明隐藏不需要的网格位置。

剧情3: Point highlights

这个解决方案的问题在于它非常高兴,并且尝试将那些与geom_path联系起来的是混乱的混乱。我也尝试了更粗略的舍入,这让事情变得浑浊。

很想听到其他想法!感谢