我需要帮助为gxplot + geom_tile()为86x86矩阵分配正确的十六进制颜色代码。它是一个相关矩阵,我想根据它的值和由kmeans聚类生成的类来为它着色。有六种不同的簇/颜色。这是伪代码:
value[i,j] < 0.7, color '#FBB4AE'
value[i] == value[j] then color it according to its cluster value from kmeans
else: color '#FED9A6'
以下是数据片段(11x6):
1 1.000000000 0.39444675 0.71206533 0.45434411 0.39223227 0.450000000
2 0.394446746 1.00000000 0.67660082 0.52710164 0.48768778 0.457329560
3 0.712065332 0.67660082 1.00000000 0.66864785 0.52839595 0.641500299
4 0.454344111 0.52710164 0.66864785 1.00000000 0.52414242 0.356348323
5 0.392232270 0.48768778 0.52839595 0.52414242 1.00000000 -0.147087101
6 0.450000000 0.45732956 0.64150030 0.35634832 -0.14708710 1.000000000
7 0.511111111 0.35252487 0.64150030 0.84632727 0.27238352 0.490740741
8 0.064888568 0.26429707 -0.01560976 0.08671100 -0.07953560 0.243332132
9 0.307350428 0.40105559 0.52720311 0.80357143 0.38000325 0.356348323
10 0.509636861 0.25374774 0.44294040 0.19771865 -0.04836194 0.630196118
11 0.394557570 0.21145645 0.07909650 0.52724973 0.22568906 -0.027399831
我有一个名为flavors.color
的单独(7396x1)向量,其中包含与86x86矩阵的每个元素对应的十六进制颜色代码。这些颜色代码基于我上面陈述的条件。顶部是每个元素的出现表。 #CCCCCC最常见。
融化后:
p<-ggplot(data=corr.melt,aes(Var1,Var2)) + geom_tile(aes(fill=flavors.color),color="white")
p+ scale_fill_manual(values = unique(flavors.color))
#CCCCCC
是'灰色'但是在我的情节中它将它染成紫色。我从brewer.pal(6,"Set2")
定义了我的颜色,并手动添加了另外两种颜色,#CCCCCC
和#FFFFCC
。在Set2
紫色位于第四位。所以,'灰色','白色'和'紫色'混在一起,我不知道为什么。这是结果的照片。
答案 0 :(得分:1)
您可以通过创建86x86网格来完成此操作。
x <- seq(1,86)
y <- seq(1,86)
yxs <- expand.grid(x,y)
yxs$flavors.color <- flavors.color
ggplot(yxs,aes(x=Var1,y=Var2))+geom_tile(aes(fill=flavors.color))