Question

这里有相当不知情的linux（ubuntu 14.04）用户。我正在尝试安装名为Bowtie2的生物信息学程序 - 我收到此错误并且不确定它来自何处。他们确实在他们的网站上引用了这个可能与它有关的内容，但没有提到它作为依赖。

TBB现在是默认的线程库。我们始终如一地发现TBB 提供优质的线程缩放。它广泛可用并且广泛使用安装。也就是说，我们也保留了“遗留”版本与先前版本一样，Bowtie不使用TBB。编译传统模式下的Bowtie源使用NO_TBB = 1。要使用旧版二进制文件，下载名称中带有“legacy”的相应二进制存档。

sam@SumnerLab-Computer:~/Program_Files/bowtie-1.2$ make
g++ -w -O3 -m64 -DCOMPILER_OPTIONS="\"-O3 -m64  -Wl,--hash-style=both -DWITH_TBB -DPOPCNT_CAPABILITY -DNO_SPINLOCK -DWITH_QUEUELOCK=1  \""  -Wl,--hash-style=both -DWITH_TBB -DPOPCNT_CAPABILITY -DNO_SPINLOCK -DWITH_QUEUELOCK=1    \
    -fno-strict-aliasing -DBOWTIE_VERSION="\"`cat VERSION`\"" -DBUILD_HOST="\"`hostname`\"" -DBUILD_TIME="\"`date`\"" -DCOMPILER_VERSION="\"`g++ -w -v 2>&1 | tail -1`\"" -D_LARGEFILE_SOURCE -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_GNU_SOURCE  -DPREFETCH_LOCALITY=2 -DBOWTIE_MM -DBOWTIE_SHARED_MEM -DNDEBUG -Wall \
    -I SeqAn-1.1 -I third_party -I third_party \
    -o bowtie-build-s ebwt_build.cpp \
    ccnt_lut.cpp ref_read.cpp alphabet.cpp shmem.cpp edit.cpp ebwt.cpp  bowtie_build_main.cpp \
    -lpthread -ltbb -ltbbmalloc_proxy 
In file included from pat.h:17:0,
                 from sequence_io.h:12,
                 from multikey_qsort.h:8,
                 from diff_sample.h:8,
                 from blockwise_sa.h:13,
                 from ebwt.h:27,
                 from ebwt_build.cpp:11:
threading.h:10:24: fatal error: tbb/mutex.h: No such file or directory
compilation terminated.
Makefile:259: recipe for target 'bowtie-build-s' failed
make: *** [bowtie-build-s] Error 1

任何想法可能是什么问题？

感谢

Answer 1

您可能需要安装TBB开发包，例如： libtbb-dev。

在Ubuntu上，运行sudo apt-get install libtbb-dev

Answer 2

sudo apt-get install libtbb-dev

请

threading.h：10：24：致命错误安装错误

2 个答案: