Question

我正在使用rpy2与mgcv pkg进行通信，以获得gam预测。

我可以通过使用mgcv pkg来获得一个gam，但是当我尝试使用预测方法时，它会错误地显示错误：

NameError：名称'predict'未定义

以下是我的代码。

import pandas as pd 
import numpy as np
from rpy2.robjects.packages import importr
import rpy2.robjects as ro
import pandas.rpy.common as com
from rpy2.robjects import pandas2ri

pandas2ri.activate()
r_mgcv = importr('mgcv')
base = importr('base')

MainDt = pd.read_csv(FileLocation, header=0)
R_MainDF = com.convert_to_r_dataframe(MainDt)

modparams = "PGOOD ~ "

for c in R_MainDF.colnames:
    if 'RAW' in str(c):
        modparams += " s (`" + c + "`) + " 

modparams = str(modparams)[:-2]
gamFit = r_mgcv.gam(ro.Formula(modparams), data=R_MainDF)

以下行错误输出：

eolPred= r_mgcv.predict(gamFit,newdata=R_MainDF, type="terms")
r_mgcv.matrix(ro.NA_Character,base.nrow(R_MainDF), base.ncol(R_MainDF)-2)

我做错了什么？

Answer 1

正如错误所说：

NameError: name 'predict' is not defined

在命名空间predict中找不到

r_mgcv。

检查如何在此处找到R符号的位置（在哪个包/命名空间中）： http://rpy2.readthedocs.io/en/version_2.8.x/robjects_rpackages.html#finding-where-an-r-symbol-is-coming-from

使用rpy2时无法在mgcv包中找到预测值

1 个答案: