您好我正在尝试使用partykit中的ctree提取存储在R中常量派对对象中的一些内部节点信息,但我发现导航对象有点困难,我能够显示有关的信息一个情节,但我不知道如何提取信息 - 我认为它需要nodeapply或partykit中的其他功能?
library(partykit)
irisct <- ctree(Species ~ .,data = iris)
plot(irisct, inner_panel = node_barplot(irisct))
绘制的函数可以访问所有信息,但我的文本输出类似于: Example output
答案 0 :(得分:5)
主要技巧(如前面指出的@ G5W)是获取[id]
对象的party
子集,然后提取数据(通过$data
或使用{ {1}} function)包含响应。我建议首先建立一个绝对频率的表,然后从中计算相对和边际频率。使用data_party()
对象可以通过
irisct
然后我们可以为一个漂亮的tab <- sapply(1:length(irisct), function(id) {
y <- data_party(irisct[id])
y <- y[["(response)"]]
table(y)
})
tab
## [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6] [,7]
## setosa 50 50 0 0 0 0 0
## versicolor 50 0 50 49 45 4 1
## virginica 50 0 50 5 1 4 45
对象添加一些格式:
table
然后使用colnames(tab) <- 1:length(irisct)
tab <- as.table(tab)
names(dimnames(tab)) <- c("Species", "Node")
和prop.table()
计算我们感兴趣的频率。margin.table()
方法从as.data.frame()
布局转换为&#34; long&# 34; table
:
data.frame
可以使用(仍然未导出的)as.data.frame(prop.table(tab, 1))
## Species Node Freq
## 1 setosa 1 0.500000000
## 2 versicolor 1 0.251256281
## 3 virginica 1 0.322580645
## 4 setosa 2 0.500000000
## 5 versicolor 2 0.000000000
## 6 virginica 2 0.000000000
## 7 setosa 3 0.000000000
## 8 versicolor 3 0.251256281
## 9 virginica 3 0.322580645
## 10 setosa 4 0.000000000
## 11 versicolor 4 0.246231156
## 12 virginica 4 0.032258065
## 13 setosa 5 0.000000000
## 14 versicolor 5 0.226130653
## 15 virginica 5 0.006451613
## 16 setosa 6 0.000000000
## 17 versicolor 6 0.020100503
## 18 virginica 6 0.025806452
## 19 setosa 7 0.000000000
## 20 versicolor 7 0.005025126
## 21 virginica 7 0.290322581
as.data.frame(margin.table(tab, 2))
## Node Freq
## 1 1 150
## 2 2 50
## 3 3 100
## 4 4 54
## 5 5 46
## 6 6 8
## 7 7 46
函数获取拆分信息。您只需要询问所有节点ID(默认情况下仅使用终端节点ID):
.list.rules.party()
答案 1 :(得分:2)
您需要的大部分信息都可以轻松访问。 我将展示如何获取信息,但让您格式化 把信息变成漂亮的桌子。
请注意,您的树结构irisct
只是每个节点的列表。
length(irisct)
[1] 7
每个节点都有一个字段data
,其中包含已降低的点
这一点在树中,所以你可以得到节点的观测数量
通过计算行数。
dim(irisct[4]$data)
[1] 54 5
nrow(irisct[4]$data)
[1] 54
或者一次完成所有这些以获得你的桌子2
NObs = sapply(1:7, function(n) { nrow(irisct[n]$data) })
NObs
[1] 150 50 100 54 46 8 46
节点上的第一列数据是类(Species), 这样你就可以得到每个班级的计数和每个班级的概率 在一个节点
table(irisct[4]$data[1])
setosa versicolor virginica
0 49 5
table(irisct[4]$data[1]) / NObs[4]
setosa versicolor virginica
0.00000000 0.90740741 0.09259259
表3中的拆分信息有点尴尬。仍然, 您可以通过打印出来获得所需内容的文本版本 顶级节点
irisct[1]
Model formula:
Species ~ Sepal.Length + Sepal.Width + Petal.Length + Petal.Width
Fitted party:
[1] root
| [2] Petal.Length <= 1.9: setosa (n = 50, err = 0.0%)
| [3] Petal.Length > 1.9
| | [4] Petal.Width <= 1.7
| | | [5] Petal.Length <= 4.8: versicolor (n = 46, err = 2.2%)
| | | [6] Petal.Length > 4.8: versicolor (n = 8, err = 50.0%)
| | [7] Petal.Width > 1.7: virginica (n = 46, err = 2.2%)
Number of inner nodes: 3
Number of terminal nodes: 4
保存输出以进行解析和显示
TreeSplits = capture.output(print(irisct[1]))