假设我有一个Spark DataFrame,我想将其保存为CSV文件。在 Spark 2.0.0 之后, DataFrameWriter 类直接支持将其另存为CSV文件。
默认行为是将输出保存在提供的路径中的多个 part - * .csv 文件中。
如何使用以下方式保存DF:
处理它的一种方法是合并DF然后保存文件。
df.coalesce(1).write.option("header", "true").csv("sample_file.csv")
然而,在主机上收集它并且需要拥有足够内存的主机时,这是不利的。
是否可以在不使用合并的情况下编写单个CSV文件?如果没有,是否有比上述代码更有效的方法?
答案 0 :(得分:8)
我自己使用 pyspark 和dbutils解决了这个问题,以获取.csv并重命名为所需的文件名。
save_location= "s3a://landing-bucket-test/export/"+year
csv_location = save_location+"temp.folder'
file_location = save_location+'export.csv'
df.repartition(1).write.csv(path=csv_location, mode="append", header="true")
file = dbutils.fs.ls(csv_location)[-1].path
dbutils.fs.cp(file, file_location)
dbutils.fs.rm(csv_location, recurse=True)
这个答案可以通过不使用[-1]来改进,但.csv似乎永远是文件夹中的最后一个。如果您只处理较小的文件并且可以使用重新分区(1)或合并(1),则可以使用简单快速的解决方案。
答案 1 :(得分:5)
使用:
what_for
有关详细信息,请参阅文档: https://spark.apache.org/docs/latest/api/python/pyspark.sql.html?highlight=dataframe#pyspark.sql.DataFrame.toPandas
答案 2 :(得分:1)
此解决方案基于Shell脚本,并未进行并行化,但仍然非常快,尤其是在SSD上。它在Unix系统上使用cat
并输出重定向。假设包含分区的CSV目录位于/my/csv/dir
,输出文件为/my/csv/output.csv
:
#!/bin/bash
echo "col1,col2,col3" > /my/csv/output.csv
for i in /my/csv/dir/*.csv ; do
echo "Processing $i"
cat $i >> /my/csv/output.csv
rm $i
done
echo "Done"
在将每个分区附加到最终的CSV后,它将删除每个分区以释放空间。
"col1,col2,col3"
是CSV标头(此处我们有三列名称col1
,col2
和col3
)。你必须告诉Spark不要在每个分区中放置标题(这是用.option("header", "false")
完成的,因为Shell脚本会这样做。
答案 3 :(得分:1)
对于那些仍然想要这样做的人,我是如何通过使用带有java.nio.file
帮助的scala中的spark 2.1来完成它的。
基于https://fullstackml.com/how-to-export-data-frame-from-apache-spark-3215274ee9d6
val df: org.apache.spark.sql.DataFrame = ??? // data frame to write
val file: java.nio.file.Path = ??? // target output file (i.e. 'out.csv')
import scala.collection.JavaConversions._
// write csv into temp directory which contains the additional spark output files
// could use Files.createTempDirectory instead
val tempDir = file.getParent.resolve(file.getFileName + "_tmp")
df.coalesce(1)
.write.format("com.databricks.spark.csv")
.option("header", "true")
.save(tempDir.toAbsolutePath.toString)
// find the actual csv file
val tmpCsvFile = Files.walk(tempDir, 1).iterator().toSeq.find { p =>
val fname = p.getFileName.toString
fname.startsWith("part-00000") && fname.endsWith(".csv") && Files.isRegularFile(p)
}.get
// move to desired final path
Files.move(tmpCsvFile, file)
// delete temp directory
Files.walk(tempDir)
.sorted(java.util.Comparator.reverseOrder())
.iterator().toSeq
.foreach(Files.delete(_))
答案 4 :(得分:1)
以下 scala 方法在本地或客户端模式下工作,并将df写入所选名称的单个csv。它要求df适合内存,否则 collect()会爆炸。
import org.apache.hadoop.fs.{FileSystem, Path}
val SPARK_WRITE_LOCATION = some_directory
val SPARKSESSION = org.apache.spark.sql.SparkSession
def saveResults(results : DataFrame, filename: String) {
var fs = FileSystem.get(this.SPARKSESSION.sparkContext.hadoopConfiguration)
if (SPARKSESSION.conf.get("spark.master").toString.contains("local")) {
fs = FileSystem.getLocal(new conf.Configuration())
}
val tempWritePath = new Path(SPARK_WRITE_LOCATION)
if (fs.exists(tempWritePath)) {
val x = fs.delete(new Path(SPARK_WRITE_LOCATION), true)
assert(x)
}
if (results.count > 0) {
val hadoopFilepath = new Path(SPARK_WRITE_LOCATION, filename)
val writeStream = fs.create(hadoopFilepath, true)
val bw = new BufferedWriter( new OutputStreamWriter( writeStream, "UTF-8" ) )
val x = results.collect()
for (row : Row <- x) {
val rowString = row.mkString(start = "", sep = ",", end="\n")
bw.write(rowString)
}
bw.close()
writeStream.close()
val resultsWritePath = new Path(WRITE_DIRECTORY, filename)
if (fs.exists(resultsWritePath)) {
fs.delete(resultsWritePath, true)
}
fs.copyToLocalFile(false, hadoopFilepath, resultsWritePath, true)
} else {
System.exit(-1)
}
}
&#13;
答案 5 :(得分:0)
Hadoop API中的FileUtil.copyMerge()应该可以解决您的问题。
import org.apache.hadoop.conf.Configuration
import org.apache.hadoop.fs._
def merge(srcPath: String, dstPath: String): Unit = {
val hadoopConfig = new Configuration()
val hdfs = FileSystem.get(hadoopConfig)
FileUtil.copyMerge(hdfs, new Path(srcPath), hdfs, new Path(dstPath), true, hadoopConfig, null)
// the "true" setting deletes the source files once they are merged into the new output
}
答案 6 :(得分:0)
这是分布式计算的工作原理!目录中的多个文件正是分布式计算的工作原理,这根本不是问题,因为所有软件都可以处理它。
您的问题应该是“如何下载由多个文件组成的CSV?” - &GT; SO中已经有很多解决方案。
另一种方法可能是使用Spark作为JDBC源(使用令人敬畏的Spark Thrift服务器),编写SQL查询并将结果转换为CSV。
为了防止驱动程序中的OOM(因为驱动程序将获得ALL 数据),使用增量收集 (
spark.sql.thriftServer.incrementalCollect=true
),更多信息 http://www.russellspitzer.com/2017/05/19/Spark-Sql-Thriftserver/
关于Spark“数据分区”概念的小概述:
INPUT (X PARTITIONs) -> COMPUTING (Y PARTITIONs) -> OUTPUT (Z PARTITIONs)
在“阶段”之间,数据可以在分区之间传输,这就是“随机播放”。你想要“Z”= 1,但Y&gt; 1,没有洗牌?这是不可能的。
答案 7 :(得分:0)
df.coalesce(1).write.option("inferSchema","true").csv("/newFolder",header =
'true',dateFormat = "yyyy-MM-dd HH:mm:ss")