Question

我有一个3D脑容积（x，y）坐标和z =切片。对于这个卷，我有特定的坐标（反映了一些特征），我想突出显示这些坐标（例如通过特定颜色的绘图）。我搜索并找到了类似的代码：

for i=1:size(indx,1)
red(indx(i,1),indx(i,2),indx(i,3))=255;
green(indx(i,1),indx(i,2),indx(i,3))=0;
blue(indx(i,1),indx(i,2),indx(i,3))=0;
end
out = cat(4, red, green, blue);

问题在于，此代码适用于灰度图像。当我试图将它推广到卷时，我得到了一些大小：（x，y，z，3）到：

int i=-1,c,o,w,b,e=b=w=o=c=1;

这种概括是对的吗？如果是这样，如何用彩色部分显示结果切片？

Answer 1

你可以这样做，但数据集的大小增加了三倍，你真的没有任何收获。相反，我会创建一个标签卷，例如：

VolLabels = uint8(VolData);

VolLabels(indx) = 1; %same notation, linear indices. 'colour1'
VolLabels(indx2) = 2; %different feature, 'colour2'

然后你可以正常查看切片，即imshow（VolLabels（：，：，sliceZ））。然后，通过使用imcontrast工具，您可以通过设置限制来设置要查看的功能。玩色彩也很有帮助。

或者通过以下方式提取仅包含一个功能的卷：

VolRedLabel = VolLabels == 1; %extracts the 'colour1' label

如果您刚开始使用Matlab和CT（MRI？） - 图像检查函数isosurface（）。它停止使用更大的数据集。

在MATLAB中绘制3D体积

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