Question

我的qsub位于SGE中。因此，当通过cronjob运行sh脚本时，我收到错误：qsub：command not found。目前设置的路径是： PATH = / USR / bin中：/ bin中

Answer 1

您可以设置路径或使用qsub的完整路径作为@Jens提及。

但是，这种情况通常也意味着您的登录shell正在寻找一个为您设置一堆环境变量的文件（包括SGE_ROOT）。运行cronjob时，不会获取该文件。因此，除了修复路径（或提供qsub的完整路径）之外，您还需要找到该文件，然后在脚本的顶部，您需要获取该文件（或者通过并手动完成设置每个相关的环境变量。）

在我的系统上，该文件位于/u/local/etc/profile.d/sge.sh（所以我只将. /u/local/etc/profile.d/sge.sh放在我的脚本顶部），但文件的位置因设置而异。您只需要在登录时搜索哪个文件设置为SGE_ROOT（以及其他几个相关的环境变量，例如SGE_ARCH）。

（如果你很难找到它是哪个文件，你会发现这个答案很有用：https://unix.stackexchange.com/a/154971/157777。）

Answer 2

您可以在脚本开头设置PATH，例如与

#!/bin/sh
PATH=$(/usr/bin/getconf PATH):/some/other/dir:/yet/another/dir
...rest of script...

或修改crontab条目以提供带有

的扩充初始PATH

10 20 * * * PATH=/usr/bin:/bin:/some/other/dir:/yet/another/dir /path/to/script.sh

Answer 3

添加PATH中的完整qsub之后您可以找到SGE_ROOT并将其添加到crontab

在crontab中这样写：

SGE_ROOT=<root_name>
PATH= xxxxxxxx

如何在cronjob中设置SGE的PATH

3 个答案: