我有一个xarray数据集,其中一些变量的维度超过了必要的数量(例如,一个3D数据集,其中"纬度"和#34;经度"变量也随时间变化)。如何删除额外的尺寸?
例如,在下面的数据集中,' bar'是x
和y
轴上的2D变量,沿x
轴具有恒定的值。如何从'栏中删除x
维度'但不是' foo'?
>>> ds = xr.Dataset({'foo': (('x', 'y'), np.random.randn(2, 3))},
{'x': [1, 2], 'y': [1, 2, 3],
'bar': (('x', 'y'), [[4, 5, 6], [4, 5, 6]])})
>>> ds
<xarray.Dataset>
Dimensions: (x: 2, y: 3)
Coordinates:
* x (x) int64 1 2
* y (y) int64 1 2 3
bar (x, y) int64 4 5 6 4 5 6
Data variables:
foo (x, y) float64 -0.9595 0.6704 -1.047 0.9948 0.8241 1.643
答案 0 :(得分:5)
删除额外维度(使用索引)的最直接方法会导致稍微混淆的错误消息:
>>> ds['bar'] = ds['bar'].sel(x=1)
ValueError: dimension 'x' already exists as a scalar variable
问题在于,当您在xarray中进行索引时,它会将索引坐标保持为标量坐标:
>>> ds['bar'].sel(x=1)
<xarray.DataArray 'bar' (y: 3)>
array([4, 5, 6])
Coordinates:
x int64 1
* y (y) int64 1 2 3
bar (y) int64 4 5 6
这通常很有用,但在这种情况下,当您尝试在原始数据集上设置时,索引数组上的标量坐标'x'
与非标量坐标(和维度)'x'
冲突。因此,xarray错误而不是覆盖变量。
要解决此问题,您需要在编制索引后删除标量'x'
。在当前版本的xarray中,您可以使用drop
:
>>> ds['bar'] = ds['bar'].sel(x=1).drop('x')
>>> ds
<xarray.Dataset>
Dimensions: (x: 2, y: 3)
Coordinates:
* x (x) int64 1 2
* y (y) int64 1 2 3
bar (y) int64 4 5 6
Data variables:
foo (x, y) float64 -0.9595 0.6704 -1.047 0.9948 0.8241 1.643
在xarray的未来版本(v0.9及更高版本)中,您可以通过编写drop=True
(例如ds['bar'].sel(x=1, drop=True)
)来删除索引时的坐标。