我确实有以下数据结构......
ID value
1 1 1
2 1 63
3 1 2
4 1 58
5 2 3
6 2 4
7 3 34
8 3 25
现在我想把它变成一种二元数据结构。每个具有相同值的ID都应该有关系。
我尝试了几个选项:
df_wide <- dcast(df, ID ~ value)
......给我带来了很长的路要走......
ID 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 39 40
1 1001 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2 1006 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3 1007 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0
4 1011 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
5 1018 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
6 1020 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
7 1030 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0
8 1036 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
现在我的主要问题是把它变成一个合适的矩阵来从中获取igraph对象。
df_wide_matrix <- data.matrix(df_wide)
df_aus_wide_g <- graph.edgelist(df_wide_matrix ,directed = TRUE)
请不要让我到那里......
我也尝试将其转换为邻接矩阵......
df_wide_matrix <- get.adjacency(graph.edgelist(as.matrix(df_wide), directed=FALSE))
......但它没有工作
答案 0 :(得分:1)
如果要在具有相同值的所有ID之间创建边缘,请尝试使用此类似的内容。 merge
将数据框首先value
放到自身上。然后,删除value
列,并删除所有(无向)的重复边或只是点。最后,转换为双列矩阵并创建边。
res <- merge(df, df, by='value', all=FALSE)[,c('ID.x','ID.y')]
res <- res[res$ID.x<res$ID.y,]
resg <- graph.edgelist(as.matrix(res))