优化Python代码

时间:2017-01-23 00:55:00

标签: python datetime pandas optimization dataframe

我编写了以下代码来预处理这样的数据集:

StartLocation   StartTime   EndTime
school          Mon Jul 25 19:04:30 GMT+01:00 2016  Mon Jul 25 19:04:33 GMT+01:00 2016
...             ...         ...

它包含用户参加的具有开始和结束时间的位置列表。每个位置可能会多次出现,并且没有完整的位置列表。由此,我想聚合每个位置的数据(频率,总时间,平均时间)。为此,我编写了以下代码:

def toEpoch(x):
    try:
        x = datetime.strptime(re.sub(r":(?=[^:]+$)", "", x), '%a %b %d %H:%M:%S %Z%z %Y').strftime('%s')
    except:
        x = datetime.strptime(x, '%a %b %d %H:%M:%S %Z %Y').strftime('%s')
    x = (int(x)/60)
    return x

#Preprocess data
df = pd.read_csv('...')
for index, row in df.iterrows():
    df['StartTime'][index] = toEpoch(df['StartTime'][index])
    df['EndTime'][index] = toEpoch(df['EndTime'][index])
    df['TimeTaken'][index] = int(df['EndTime'][index]) - int(df['StartTime'][index])
total = df.groupby(df['StartLocation'].str.lower()).sum()
av = df.groupby(df['StartLocation'].str.lower()).mean()
count = df.groupby(df['StartLocation'].str.lower()).count()
output = pd.DataFrame({"location": total.index, 'total': total['TimeTaken'], 'mean': av['TimeTaken'], 'count': count['TimeTaken']})
print(output)

此代码正常运行,但效率很低。如何优化代码?

编辑:基于@Batman's有用的评论,我不再迭代。但是,我仍然希望在可能的情况下进一步优化这一点。更新的代码是:

df = pd.read_csv('...')
df['StartTime'] = df['StartTime'].apply(toEpoch)
df['EndTime'] = df['EndTime'].apply(toEpoch)
df['TimeTaken'] = df['EndTime'] - df['StartTime']
total = df.groupby(df['StartLocation'].str.lower()).sum()
av = df.groupby(df['StartLocation'].str.lower()).mean()
count = df.groupby(df['StartLocation'].str.lower()).count()
output = pd.DataFrame({"location": total.index, 'total': total['TimeTaken'], 'mean': av['TimeTaken'], 'count': count['TimeTaken']})
print(output)

2 个答案:

答案 0 :(得分:2)

我要做的第一件事是停止迭代行。

df['StartTime'] = df['StartTime'].apply(toEpoch)
df['EndTime'] = df['EndTime'].apply(toEpoch)
df['TimeTaken'] = df['EndTime'] - df['StartTime']

然后,执行一次groupby操作。

gb = df.groupby('StartLocation')
total = gb.sum()
av = gb.mean()
count = gb.count()

答案 1 :(得分:2)

  • 向量化日期转换
  • 取两个系列时间戳的差异给出一系列timedeltas
  • 使用total_seconds从timedeltas获取秒数
  • groupbyagg
# convert dates
cols = ['StartTime', 'EndTime']
df[cols] = pd.to_datetime(df[cols].stack()).unstack()

# generate timedelta then total_seconds via the `dt` accessor
df['TimeTaken'] = (df.EndTime - df.StartTime).dt.total_seconds()

# define the lower case version for cleanliness
loc_lower = df.StartLocation.str.lower()

# define `agg` functions for cleanliness
# this tells `groupby` to use 3 functions, sum, mean, and count
# it also tells what column names to use
funcs = dict(Total='sum', Mean='mean', Count='count')
df.groupby(loc_lower).TimeTaken.agg(funcs).reset_index()

enter image description here

日期转换说明

  • 为方便起见,我定义了cols
  • df[cols] =是对这两列的分配
  • pd.to_datetime()是一个矢量化日期转换器,但只需pd.Series而非pd.DataFrame
  • df[cols].stack()将2列数据框组合成一个系列,现在已准备好pd.to_datetime()
  • 按照描述使用pd.to_datetime(df[cols].stack())unstack()取回我的2列,现在可以分配。